对于意识的理解在当前认知神经科学的推动下获得了爆炸性的增长。在这一背景下,传统哲学借助思辨方法就意识的本质所提出的观点获得了新的发展,甚至受到了挑战。发展是由于新的研究方法的出现使得寻找意识确切的神经相关物的位置以及建构意识产生机制的理论得以可能,挑战则是由于新的认知神经科学实验结论与相关的传统哲学的见解发生了矛盾。结合当代认知神经科学意识研究的方法论,本文详细论述了意识问题的五个方面:第一,意识研究中的对比方法。当代脑成像技术使得无意识与意识的对比研究更为精确,通过“减法”,意识运行的神经基础和神经机制能够更加明显。但是意识研究的对比方法并不能解决意识的心-身问题。如果心-身问题本身没有得到解决,那么仅仅依靠意识的实证对比方法我们并不能真正理解意识。第二,意识的认知神经学定义。与传统哲学从感受质的角度定义意识不同,认知神经科学从“意识的神经相关物”以及信息的角度定义意识。这种定义是在其方法论的指导下,为其实证研究服务的,意识被视为一种特定类型的信息,这种信息如何体现出一种现象性,当前的科学研究还没有提供一个满意的解答。第三,意识的认识神经机制。意识研究必须说明意识是如何从物理的脑中产生和演变的。当前最具影响力的两大意识理论,全局工作空间理论和整合信息理论都在结合前者的理论上提出了各自的理论框架。从哲学上看前者代表了物理主义对意识的理解,后者代表了泛心论(更为精妙的)对于意识的理解。第四,意识机制对自由意志的解释。自由意志的实验研究必须结合对于意识的产生机制进行解释,自由意志本身作为一种有意识的自愿的意图,不能脱离意识与无意识相关作用的连贯性的整体。当代认知神经科学实证研究对于自由意志的抽取就如同我们在生物实验中提取有机体的某个横切面一样,它忽视了意识与无意识相互转换的机制,得出了错误的结论。第五,意识结构中的自我。传统哲学将意识、思维过程视为证明自我作为一个实体存在的工具,更多的关注于自我的研究。当代认知神经科学则是相反,不再将自我视为一个预设的实在,而是试图从意识的内容中去发现自我如何生成。本文从语言和精神分析两个方面论证了自我不是一个连贯性和同一性的实体,而是一个不断被建构的过程。意识的认识神经学研究也表明,当代意识的科学研究虽然扩展了意识研究的问题域,发展了意识研究的方法论,更新了解释意识机制的某些方面,但还并没有解答意识的哲学问题,这表明意识的科学研究和哲学研究在未来可以更好的相互融合和促进。