蕨类植物是一类很古老的植物类群,其系统发生信息在漫长的演化过程中发生了很多改变,因此重建其系统演化关系是蕨类植物学家所面临的重要任务之一。近年来的分子系统学研究已经确立了一些类群的系统关系,但现存的蕨类分类系统和系统发生关系还有很多谜团有待揭开。化石记录表明蕨类植物最早出现于大约4亿多年前,但大部分现代真蕨类缺少足够的化石证据。它们的起源时间和方式及其内部各类群的系统发生关系等诸多问题的解决,还有待于大量形态学和不同分子水平上的实验数据的进一步积累,并结合其直接的化石证据进行综合研究。为探讨蕨类植物的分类情况,本研究以从重庆市缙云山采集到的27种蕨类植物为研究对象,运用SRAP分子标记技术对这27种蕨类植物进行PCR扩增分类,建立聚类图谱。实验选用24对M/E引物组合,利用UPGMA法对多态性谱带进行聚类分析,结果表明：用SRAP分子标记的方法对蕨类植物进行的种属分类结果部分区别于蕨类植物的传统分类结果,它们之间存在一定的差异,但这种差异很小。这一研究结果为分子标记技术对植物分类提供了理论依据。