近年来,随着全球经济性的日益严峻,我国药品零售业的竞争也越来越白热化,医药连锁配送企业存在药品种类繁多、药品配送频率较高、缺货成本高等配送难题,这些问题使医药连锁配送企业的物流配送变得更加困难。因此,如何让医药连锁配送企业的物流配送管理更加有效,如何使企业物流配送成本最大限度地降低,成为医药连锁配送企业维系正常运营和谋求发展的关键。连锁配送企业被称为现代流通体系的两大标志之一,对连锁配送企业的物流成本进行控制,将是连锁配送企业谋求发展新思路的最佳选择。从商流方面来讲,它开创了商业界新的流通渠道,另外,从物流方面讲,它确立了新的物流运作方式。对连锁配送企业的物流成本进行控制,开拓“第三利润源”,将是连锁配送企业突破发展瓶颈、谋求新发展的良好选择。然而,随着近年来药品零售业竞争的日益加剧和企业盈利能力的不断降低,医药连锁配送企业也已经意识到提升企业经营管理水平的重要性。医药连锁配送企业有着不同于其他行业的流通特点：药品种类繁多、药品配送频率较高、缺货成本特别高等,这些特点都在一定程度上加强了医药连锁配送企业物流配送的难度。因此,如何加强、优化企业的医药连锁配送企业的物流配送管理,最大限度地降低企业物流配送成本,创造企业“第三利润源泉”,成为医药连锁配送企业维系生存和谋求发展的关键。本文首先分析了我国医药行业的现状以及发展过程,和西方发达国家的各个方面进行了对比,得出我国目前医药行业的成本相对比较高,物流成本占比比较大,为了提高利润,降低物流成本势在必行。接着选取了医药连锁配送企业为研究对象,分析了其成本的主要组成部分以及影响因素,针对行业的特殊性对医药连锁配送企业流成本控制的框架进行分析,分别在采购环节和配送环节对物流成本进行双重约束控制,并得出相关结论。最后,构建了多目标模优化型和节约里程优化模型,同时以实证分析说明了模型的应用。该研究旨在提高企业配送效率,节约配送成本,为医药连锁企业物流配送提供了科学依据。