逆转录环介导等温扩增技术对新城疫病毒的快速检测

来源 :大连医科大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:javawm
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新城疫是一种重要禽类传染病,危害严重,防控艰难。本研究利用逆转录环介导等温扩增技术(RT-LAMP)和LAMP实时检测技术建立了新城疫病毒检测方法,可以实现定性与定量测定。该方法有望替代现有的新城疫病毒核酸检测方法,实现新城疫快速确诊。该技术可以为新城疫的有效防控提供技术支撑。本研究可分为三个部分:第一部分:新城疫病毒融合蛋白基因(F基因)的克隆与序列分析参照GenBank中新城疫病毒毒株融合蛋白基因,设计合成1对特异性引物,RT-PCR扩增后将目的片段克隆到pGEM-T载体上,转化大肠杆菌感受态细胞,经蓝白斑筛选后得到重组质粒pGEM-T-NDV。重组质粒经PCR及测序鉴定,结果证实获得了新城疫病毒F基因。第二部分:新城疫病毒RT-LAMP检测方法的建立根据新城疫病毒F基因设计合成6条特异性引物,在恒温水浴中进行核酸扩增反应,对反应温度、反应时间以及反应液中[Mg2+]浓度进行优化获得最佳反应条件,结果经凝胶电泳分析并在可见光下用肉眼直接观察。在凝胶电泳分析中,扩增产物呈多条带特征性分布,肉眼观察,可见反应产物发生浑浊。整个反应过程用时0.5h,检测敏感度比RT-PCR高100倍,对其它非新城疫病毒RNA无检出。本研究建立的新城疫病毒RT-LAMP检测方法速度快、不需要高精密仪器,而且具有灵敏度高、特异性强,操作简单等特点。第三部分:新城疫病毒LAMP实时浊度定量分析在RT-LAMP检测新城疫病毒方法的基础上,建立了实时浊度检测系统对新城疫病毒的定量分析检测方法。整个检测0.5h内即可完成。原始质粒DNA模板的拷贝数在1.98×108到1.98×104范围内与浊度达到0.1的时间有着良好的线性关系,病毒的含量可以依据它达到阳性值的时间通过标准曲线而求得,同时实验也证实在LAMP反应体系中环引物能明显提高反应速率,采用稳定性和特异性实验进行验证,证实该LAMP实时浊度仪检测方法结果可靠,该方法效率高、测定准确、操作简便。
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