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维甲酸类X受体(RXR)属于核受体家族中第二亚族成员，在类固醇核受体家族中高度保守，首次是从人肝和肾细胞中的cDNA文库中，分离到了人类的hRXR。在昆虫和甲壳动物中，RXR处于蜕皮、变态及繁殖等生命过程的级联反应启动位置，对完成其生长发育和繁殖具有十分重要的作用。日本沼虾(Macrobrachium nipponense)是我国主要的淡水养殖虾类品种之一，有着很高的经济价值。本实验选取日本沼虾作为研究对象，分离和克隆了RXR的五种不同异构型基因，同时通过普通PCR法初步了解了MnRXR在胚胎发育不同发育期和不同组织的表达分布。
1.参照小鼠、斑马鱼、蟹、水蚤等其他物种的RXR基因具有较高保守性的核苷酸序列设计一对简并引物，以日本沼虾卵巢cDNA为模板，通过简并RT-PCR的方法，获得一条约200bp的条带，测序后确定得到的部分cDNA序列是日本沼虾的RXR基因。以上述所得序列设计一对特异引物进行普通RT-PCR，以管家基因beta-actin作为阳性对照，研究MnRXR在精巢、卵巢、心脏、肌肉、肝胰腺、胃、鳃、表皮、肠等组织中的表达情况。结果表明其在所有组织中均有表达，在精巢、卵巢和外表皮中表达量较高。同时，又用该对特异引物对日本沼虾在胚胎发育不同时期MnRXR的表达分布做了分析，结果显示，MnRXR在胚胎发育各个时期均有表达，且在后无节幼体期和前蚤状幼体期表达量达到最高。
2.根据获得的MnRXR部分序列分别设计特异引物进行5’RACE和3’RACE扩增，结果都分别得到了3种不同的序列，将测得的序列分别与保守区序列进行序列拼接，最终确定了5种不同的异构体形式，比较发现它们有着高度的同源性，在DBD高度保守区域都是一致的，主要是在N末端和C末端有所差异。为确保结果的准确性，分别在3’ UTR和5’UTR区域设计特异引物，进行扩增并克隆测序，证实了得到的所有序列都是完整的一个分子。经核苷酸序列分析，其中开放阅读框最长的MnRXR12，全长为1698bp，编码序列为1011bp，编码337个氨基酸，(包括polyA)，5’非编码区(5’UTR)核苷酸序列长度为354bp，3’非编码区(3’UTR)333bp，对MnRXR12所编码的氨基酸分析表明：其含有RXR核受体家族蛋白所具有的A-F区域的所有结构，并且与C、D、E区域和黑背陆地蟹的GlRXRa蛋白有着100％的一致性，进一步说明克隆的MnRXR确实是日本沼虾的RXR基因，且其氨基酸序列高度保守。从N端到C端，可以在MnRXR12的DBD区找到高度保守的P-box(EGCKG)和D-box(CREER)两个特殊结构，同时，在铰链域D域也找到了1个识别DNA的T-box，在E/F区域也有1个β-转角区域和几个a-螺旋(H1-H9)。然而，通过将日本沼虾RXRa基因氨基酸序列与其它物种的多重比较发现，所克隆的日本沼虾MnRXR12在H9螺旋处发生了中断，缺失了H9-H12的功能区域，推测日本沼虾RXR还可能存在其他异构体形式。
MnRXR13核苷酸序列全长为1659bp，编码326个氨基酸，5’UTR核苷酸序列长度为348bp，3’UTR为333bp；MnRXRs1核苷酸序列全长为1193bp，编码277个氨基酸，5’UTR为核苷酸序列长度为99bp，3’UTR为263bp；MnRXRs2核苷酸序列全长为1346bp，编码243个氨基酸，5’UTR为核苷酸序列长度为354bp，3’UTR为263bp；MnRXRs3核苷酸序列全长为1292bp，编码227个氨基酸，5’UTR为核苷酸序列长度为348bp，3’UTR为263bp。对比5个不同构型的核苷酸序列，发现日本沼虾卵巢RXR的cDNA共有四个不同的剪切位点，一个发生在5’端A/B区，产生了3种不同形式的5’端序列；一个在RXR受体结构的D区即铰链区域，使T-盒区长度也有3种形式(+12/+7/+7△5)，两个发生在LBD区，其中一个是在H1-H3螺旋区域，产生了2种不同形式(MnRXRl/MnRXRs)，另外一个是在D区产生了中断，缺失了E/F区域(MnRXRm)。
3.根据得到的5个亚型的全全长序列，设计特异引物进行普通RT-PCR，研究了各亚型在不同组织及胚胎发育不同时期MnRXR的表达分布情况，结果显示，在卵巢组织中及胚胎发育早期卵裂期所有的亚型均有表达，且MnRXRs3只在卵巢中特异表达；在其他组织中，各亚型的表达分布不尽相同，揭示了不同亚型可能参与了不同的生理功能。
尽管RXR在脊椎动物中有广泛深入的研究，在甲壳动物中也有相关的数据，但是在甲壳类中，只有在陆地蟹G.lateralis中有众多的RXR异构体形式，且因A/B区有剪切位点不同导致的不同构型目前还未报道，且在卵巢中特异表达的MnRXRs3的发现为日本沼虾性别分化方面提供了新的视角，本研究结果为RXR的基础研究提供了宝贵的资料，对进一步研究其生理功能拓宽了广度。