随着我国经济社会不断发展,人民生活质量不断提高,食品安全已成为影响人民正常生活和身体健康的重要问题。近年来,由于非法添加、农兽药残留超标和重金属污染等造成的农产品质量安全问题时有发生,特别是消费者购买的农产品出现质量安全问题后,难以找到责任主体,严重损害了消费者的切身利益,由此引发了消费者对农产品质量安全监管工作的强烈不满。解决农产品质量安全问题的二个有效方法是建立农产品质量安全追溯系统。在国家政府的号召下,从2009年开始,我国各地区陆续开始建立本区域的农产品追溯系统,但大多只是昙花一现,很快就缺乏运营动力。在此背景下,我国农业部即将建立“全国农产品追溯管理平台”,本论文顺应国内现实需要,在研究了农产品质量安全追溯基础理论的基础上,从追溯系统业务流程入手,尝试解决我国农产品追溯发展的问题。首先对我国追溯的几个重要概念进行界定,并简述了我国农产品追溯发展的现实基础；接着对我国几个比较典型的农产品追溯系统进行分析,总结出其追溯系统业务流程主要分为两类：一类是以农业部种植业产品追溯系统为代表的注重内部追溯的业务流程,一类是以无锡市肉菜追溯体系为代表的注重外部追溯的业务流程。笔者分析了两类流程的特点以及存在的问题,在此基础上提出了设计我国农产品追溯系统业务流程的目标和要点,并设计出了各主体具体的业务流程。紧接着通过对设计出的流程与农业部门、商务部门的业务流程进行对比,得出了通过该流程可以提高流程的运作效率、整合内部追溯信息与外部追溯信息和实现从农田到餐桌的全过程追溯的结论,最后通过流程设计在北京市猪肉追溯中的应用作为实例分析,验证流程设计的有效性。