江华苦茶是湖南省1987年认定的优良地方群体品种。主要分布在湖南省南部江华地区的南岭山脉,是宝贵的茶树资源。本研究在对江华苦茶进行资源深入调查的基础上,采用荧光SSR分子标记技术与cpDNA序列分析技术相结合的方法,对江华苦茶4个自然居群的32份资源进行了亲缘关系、遗传多样性和遗传分化的研究。研究结果如下:1.在江华县不同地域收集样品,先后获得27个代表性较高的样品,结合湖南省茶叶研究所茶园的江华苦茶五个样品,总共32个样品,用于本次实验。2、提取样品的DNA后进行了适用引物的筛选,最后选定四对引物进行cpDNA测序研究,测序结果表明变异率约为0.78%,采用MP法进行构建分子系统树,将参试的32个样品分成4个大类。而用Dnasp进行单倍型分析之后,被分为五个单倍型,构筑这五个单倍型的网状进化图,可以发现江华苦茶32个资源样品之间的cpDNA演化关系。进行中性检测和失配分析之后,认为江华苦茶没有发生扩张事件。在进行综合计算之后发现江华苦茶的cpDNA变异主要出现在地域内,居群内,比率为89.29%。3、采用荧光SSR分子标记技术对提取获得的江华苦茶DNA进行研究,获得数据采用popgen软件进行分析。13个多态性高、重复性好的荧光SSR引物在32个资源样品当中共获得99条谱带,位点数（na）、有效位点数（ne）、Shannon信息指数（I）分别为7.62、3.38、1.39。江华苦茶群体的期望杂合度（Ho）、观测杂合度（He）、Nei’s观测杂合度（Nei）分别为0.56、0.65、0.64,经过与其他地方的检测结果进行对比,可以发现江华苦茶群体具有较高的遗传多样性。计算获得的F_ST为0.0971,表明江华苦茶基因流比较强劲,居群间遗传分化水平较低,AMOVA数据分析也表明江华苦茶SSR的变异主要出现在地域内,居群内,比率为90.89%。居群间遗传距离和遗传一致性研究体现了江华苦茶的多样性很大程度上受到人类活动的影响。用ntsys软件进行资源间分析之后,获得资源间遗传相似性的表格,并进一步获得聚类图。研究结果表明江华苦茶群体作为湖南地方具有较高的遗传多样性,在资源育种方面有着较高的利用价值。而江华苦茶的遗传多样性主要发生在地区内,居群内,历史上没有发生扩张事件,本研究为我们更好的进行苦茶资源的收集保护研究工作打下了基础。