木薯MeERFs转录因子调控的抗病通路初步分析

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在植物应答逆境胁迫的过程中,转录因子发挥了重要的调节作用,乙烯响应因子(ERF,Ethylene Response Factor)是植物应答生物和非生物胁迫的主要调节因子,乙烯和病害都能引起ERF转录因子的表达,它们大部分会与下游基因启动子区的顺式作用元件GCC-box结合来调节基因的表达,而GCC-box一般广泛出现于大量PR蛋白的启动子区。木薯(Manihot esculenta Crantz)是热带地区重要的粮食作物,也是重要的经济作物和能源作物。然而,木薯的产量总是受到木薯细菌性枯萎病(Cassava bacterial blight,CBB)的严重制约。因此,深入研究ERF转录因子在木薯应答病原菌Xam浸染中的作用具有重要意义。本研究以华南8号木薯为实验材料,克隆了ERF家族的6个基因,并通过表达模式分析、亚细胞定位、转录自激活活性分析、VIGS等技术对候选的6个基因的功能进行了初步研究,取得主要实验结果如下:1.生物信息学分析发现:6个MeERFs都分布在木薯不同的染色体上,都只含有一个外显子。启动子预测分析:MeERF08,MeERF33,MeERF56,MeERF113,MeERF133,MeERF138的启动子区都含有大量的光响应元件和多种防御和胁迫响应元件(TC-rich repeats);组织特异性分析分析:MeERF08,MeERF33,MeERF56,MeERF113,MeERF133,MeERF138在木薯品种W14的根中均表现出较高的转录丰度(FPKM值>10),而在叶片的转录丰度普遍较低;病原菌侵染下表达模式分析:MeERF08,MeERF33,MeERF56,MeERF113,MeERF133,MeERF138转录因子均可以被强致病菌株诱导表达,被弱致病菌株抑制表达,其中MeERF08,MeERF33,MeERF133这3个转录因子的表达差异最为显著。2.VIGS系统分析MeERFs在木薯抗病方面的作用,结果表明:MeERF08沉默效果不佳,其他MeERFs都能被有效沉默,且p YY13-MeERF33、p YY13-MeERF113沉默植株产生的水渍状浸斑扩散面积和褐色病斑面积均小于野生型,沉默后的植株抗病性明显增强;p YY13-MeERF56、p YY13-MeERF133和p YY13-MeERF138沉默植株产生的水渍状浸斑和褐色病斑面积明显大于野生型,沉默后的植株抗病性明显减弱。3.亚细胞定位结果表明:MeERF113定位在在细胞核中,MeERF08、MeERF33、MeERF138在细胞核和细胞膜中都有表达,MeERF56在细胞核、细胞膜、细胞质中均表达。4.转录自激活活性分析结果:MeERF33、MeERF56无转录自激活活性,MeERF113、MeERF133有较强的转录自激活活性,而MeERF08、MeERF138转录自激活活性较弱。5.酵母点对点技术分析MeMAPKs蛋白与MeERFs转录因子的互作情况,筛选出2对可能的互作蛋白,MeMAPK2、MeMAPK8分别与MeERF33互作。6.MeERFs转录因子下游靶基因染色体位置分布:木薯的18条染色体上均有分布;病原菌侵染下的表达模式分析:有26个基因能够被强致病菌株诱导表达,被弱致病菌株抑制表达。7.双荧光素酶报告系统研究MeERFs转录因子与下游靶基因Manes.02G024800、Manes.18G073800之间的调控关系:MeERF08、MeERF56正调控Manes.02G024800;MeERF133负调控Manes.02G024800;MeERFs转录因子与Manes.18G073800之间的调控关系有待进一步研究。
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