上市公司提高市值和股东增加资产的主要手段之一就是投资决策。在市场效率最优并且不存在代理冲突的前提下，公司可以通过做出最有效率的投资决策使公司追求利益最大化。不过，目前市场的有效性特别有限，公司的代理问题也比较明显，非效率投资现象比比皆是。提高投资效率有助于公司科学规划筹资、投资活动，让资金的利用更加有效合理，这样在最大程度上保证公司的创收完成。同时，伴随公司治理和风险管理更加深入普遍的钻研，在囊括投资管理在内的公司治理范畴内，公司内部控制的效用日趋突出。所以，本文以内部控制配套指引的公布实施作为时机，以内部控制三大目标为出发点，以我国上市公司为例，重点探讨了内部控制对非效率投资的影响，目的在于经过实证方法检验内部控制对非效率投资的影响，从而为提高公司投资效率探索方法和路径。本文以上海证券交易所A股上市公司的2010至2012为时三年的数据为样本，通过内部控制三大目标衡量内部控制的有效性，并借助主成分分析法计算出经营性目标的综合得分，作为模型中主要自变量；其次，参考Richardson（2006）对于投资效率的模型衡量出各上市公司的非效率投资程度，作为模型中主要的因变量。通过构建回归模型，对样本有关变量进行描述性统计、多重共线性检验以及回归分析，实证检验了内部控制对上市公司非效率投资的影响。最后，将样本按产权性质划分为国有控股与非国有控股，再一次进行实证检验。实证结果表明：内部控制对于上市公司投资过度、投资不足均有抑制作用；内部控制三大目标，经营效率效果、审计意见类型、违规处罚均与投资过度、投资不足显著负相关；在其他条件一定的情况下，国有控股上市公司中内部控制与非效率投资之间的负相关性比非国有控股上市公司更显著。