NBS-encoding基因家族包括NBS-only类型和NBS-LRR类型的基因,且NBS-LRR基因家族是植物中最大的抗病基因家族之一,在抵御病原体的侵染过程中起到重要的作用。对NBS-encoding基因家族的分析研究对植物抗病基因的鉴定和筛选具有重要的意义。板栗和猕猴桃是我国重要的经济果树,都含有较高的营养价值,但是病害严重制约板栗和猕猴桃产业的发展。所以,对板栗和猕猴桃的抗病基因的研究对于优化农业生产显得尤为重要。本研究利用生物信息学的方法,从基因鉴定、家族划分、复制时间、复制方式、选择压和启动子区域的顺式调控元件分析等几个方面,对板栗和猕猴桃的NBS-encoding基因进行了分析。1、本研究中我们从板栗全基因组中鉴定出519个NBS-encoding基因,其中含有374个NBS-LRR基因,复制时间相对古老,且复制方式为物种内特异性复制。我们计算了Ka/K 来判断基因受到的选择压作用,结果表明:大部分家族受到纯化选择,也有小部分家族受到了正选择压力。以Ks = 0.4～0.5为界,越新近和越古老的基因受到越大的选择压力作用。另外,我们发现RPW8-NBS-encoding基因群体是独立于non-TIR-NBS-encoding基因的群体,且位于进化树相对基部的位置。此外,NBS-encoding家族基因的启动子区域含有很多与植物抗性防御相关的顺式调控元件。2、我们利用同样的方法,在猕猴桃基因组中共鉴定出96个NBS-encoding基因,其中含有74个NBS-LRR基因。Ks频率分布显示,该家族的复制时间是新近的,而且越新近的基因在进化过程中受到越小的选择压作用。绝大多数的基因家族的Ka/Ks小于1,说明纯化选择起重要的作用;同时,鉴定出6个基因家族中125个氨基酸位点受到正选择作用。