稻瘟病菌漆酶基因的生物信息学分析及其功能验证

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漆酶(EC 1.10.3.1),是一种能够催化酚类物质氧化还原反应的含铜多酚氧化酶。漆酶具有很多重要的生物学作用,在高等植物上漆酶主要与降解木质素有关,在真菌上漆酶的活性与色素的形成、子实体的形成、木质素的降解、分生孢子的致病性和脱毒等作用有关;漆酶因具有降解木质素和使苯氧基类除草剂等有毒酚类物质无毒化的作用,还可去除石油工业废水的毒性,所以在造纸、饮料加工和环保等方面具有广泛的应用前景。本研究主要在生物信息学的基础上,对稻瘟菌的漆酶基因进行了研究,并克隆了其中一个漆酶基因,做了过量表达分析。 将GenBank中搜索到的模式生物粗糙脉孢菌Neurospora crsssa漆酶蛋白的氨基酸保守序列,提交到稻瘟菌全基因组数据库中经BlastP,找到了13个与漆酶相关的蛋白,其中只有MG09139.4相对应的基因没有内含子,其它几个基因含有1-6个内含子不等;进一步分析13个假设蛋白对应的基因,结果发现其中两个基因(MG09139.4,MG07771.4)的EST在NCBI上有相关的登陆;软件SignalP3.0预测结果表明MG07771.4几乎不存在信号肽的可能性,MG09139.4是信号肽的可能性为95.5%,并且以99.6%的可能性在第18和19个氨基酸上剪切;TMHMM跨膜蛋白预测结果显示跨膜螺旋的氨基酸数为2.83118个,N端在细胞质膜上的可能性为0.13339;软件ProtComp v6.0对MG09139.4在细胞中的位置进行预测的结果表明该蛋白是一个胞外分泌的蛋白;软件PredictProtein对该蛋白的二级结构进行预测,结果α螺旋占10.385%,β折叠占17.586%;漆酶蛋白的保守域(CDD)预测结果:保守区有116个氨基酸,蛋白家族数据库(Pfam)中的多铜氧化酶(gnl|CDD|25500)的保守域相似性达到96.8%,与另一个多铜氧化酶(gnl|CDD|11840)的保守域的相似性达到88.9%;用DNAstar分析此酶得出分子量65980.78道尔顿,等电点PI为6.66,此酶含有597个氨基酸,疏水氨基酸198个,极性氨基酸191个;通过与GenBank中其它生物的漆酶蛋白的氨基酸序列的比对,绘制出了系统进化树,预测了稻瘟病菌漆酶蛋白在漆酶进化中的位置。 本研究还以稻瘟病菌的测序菌株(70-15)为材料,克隆了与蛋白MG09139.4相对应的漆酶基因Laczcz。利用XhoI和SpeI位点将漆酶基因Laczcz正向插入到真核表达载体pTE11的强启动子RP27之下,构建了过量表达载体pTE11-LAC,通过与稻瘟病菌原生质体的共培养和两次含潮霉素(200ug/m1)的培养基的抗性筛选,获得68个突变体;提取基因组DNA验证,得到2个阳性过量表达突变体。这将有助于我们发现漆酶基因在稻瘟病菌中的作用。
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