CFH、LOC387715/ARMS2及HTRA1基因多态性与年龄相关性黄斑变性关系的研究

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【目的】探讨补体因子H(complement factor H,CFH)、年龄相关性黄斑病变易感因子2(age-related maculopathy susceptibility2,LOC387715/ARMS2)及高温必需因子A-1(high temperature factor A-1,HTRA1)等位基因、基因型的分布频率在中国北方人群湿性AMD(Exudative Age-related macular degeneration,Exudative AMD)患者组及健康对照组间的差异。研究CFH(Y402H rs1061170、-257C>T rs3753394、IVSl5 rs1329428)、LOC387715/ARMS2 rs10490924、HTRA1rs11200638基因多态性在中国北方人群湿性AMD的发病机制中所起的作用,以期从分子遗传学角度揭示CFH、LOC387715/ARMS2及HTRA1基因多态性与中国北方人群湿性AMD易感性的关系。【方法】本课题的研究对象包括湿性AMD患者159例(其中用于CFH基因多态性研究136人、用于LOC387715/ARMS2、HTRA1基因多态性研究159人),年龄、性别匹配的健康对照组140例。抽提受试者外周血中基因组DNA,多聚酶链式反应扩增特异DNA片断,限制型片断长度多态性(RFLP)检测基因多态性。酶切产物经2%琼脂糖凝胶电泳,成像于紫外灯下观察结果以确定基因型;上述电泳结果均用全自动凝胶成像系统照相后保存结果。用SPSS13.0统计软件包进行Hardy-Weinberg平衡定律检验,观察各组是否来自同一孟德尔群体;用SHEsis软件对观察到的基因型进行单倍型构建,并用Haploview v4.1软件进行验证。比较各组间等位基因和基因型频率分布差异,用SPSS13.0统计软件包分析等位基因和基因型与湿性AMD的关系,评价它们之间的相关性。一般临床资料中计量资料均采用χ±S表示,对连续性变量用t检验、分类数据χ2检验,所有统计分析均为双侧检验,以P<0.05为差异有显著性。【结果】1、CFH Y402H rs1061170:健康对照组:基因型分布为CC占1.4%,CT 15.0%,TT 83.6%;等位基因分布频率为C 8.9%,T 91.1%。Hardy-Weinberg平衡定律检验χ2=0.844,P=0.358。湿性AMD组:基因型分布为CC 2.9%,CT 41.2%,TT 55.97%;等位基因分布频率为C 23.5%,T 76.5%。Hardy-Weinberg平衡定律检验χ2=1.415,P=0.234。P>0.05说明群体基因遗传平衡,数据来自同一孟德尔群体。Y402H rs1061170基因型在湿性AMD患者与健康对照组中的分布有显著性差异,χ2=18.566(P<0.05),C等位基因频率在湿性AMD患者(23.5%)与健康对照组(8.9%)的分布有显著性差异,χ2=16.504(P<0.05)。Y402H rs1061170与湿性AMD显著相关:ORhom=3.079(0.55~17.23),ORhet=4.105(2.3~7.32)。2、CFH-257C>T rs3753394:健康对照组:基因型分布为纯合子TT型占33.8%,杂合子TC型占48.9%,纯合子CC型占17.3%;等位基因分布频率为T 58.3%,C 41.7%。Hardy-Weinberg平衡定律检验χ2=0.005,P=0.944。湿性AMD组:基因型分布为TT 51.5%,TC 38.2%,CC 10.3%;等位基因分布频率为T 70.6%,C 29.4%。Hardy-Weinberg平衡定律检验χ2=0.426,P=0.514。P>0.05说明群体基因遗传平衡,数据来自同一孟德尔群体。-257C>T rs3753394基因型在湿性AMD患者与健康对照组中的分布有显著性差异,χ2=6.224(P<0.05);T等位基因频率在湿性AMD患者(70.6%)与健康对照组(58.3%)的分布有显著性差异,χ2=5.898(P<0.05)。-257C>T rs3753394与湿性AMD显著相关ORho4=2.55(1.2-5.44),ORhet=1.311(0.5-3.41)。3、CFH IVS15 rs1329428:健康对照组:基因型分布为GG占23.6%,GA49.3%,AA27.1%;等位基因分布频率为G 48.2%,A 51.8%。Hardy-Weinberg平衡定律检验χ2=0.0238,P=0.877。湿性AMD组:基因型分布为GG 39.7%,GA 45.6%,AA 14.7%;等位基因分布频率为C 62.5%,T 37.5%。Hardy-Weinberg平衡定律检验χ2=0.0512,P=0.821。P>0.05说明群体基因遗传平衡,数据来自同一孟德尔群体。IVS15(rs1329428)基因型在湿性AMD患者与健康对照组中的分布有显著性差异,χ2=7.328(P<0.05),C等位基因频率在湿性AMD患者(68.5%)与健康对照组(48.2%)的分布有显著性差异,χ2=7.497(P<0.05)。IVS15 rs1329428与湿性AMD显著相关:ORhom=3.109(1.31~7.37),ORhet=1.707(0.76~3.86)。4、LOC387715/ARMS2 rs10490924:健康对照组:基因型分布为纯合子GG型占37.9%,杂合子GT型占47.9%,纯合子TT型占14.3%;等位基因分布频率为G 61.8%,T 38.2%。Hardy-Weinberg平衡定律检验χ2=0.025,P=0.874。湿性AMD组:基因型分布为GG 10.7%,GT 45.9%,TT 43.4%;等位基因分布频率为G 33.6%,T 66.4%。Hardy-Weinberg平衡定律检验χ2=0.127,P=0.722。P>0.05说明群体基因遗传平衡,数据来自同一孟德尔群体。LOC387715/ARMS2 rs10490924基因型在湿性AMD患者与健康对照组中的分布有显著性差异,χ2=44.72(P<0.05);T等位基因频率在湿性AMD患者(66.4%)与健康对照组(38.2%)的分布有显著性差异,χ2=23.02(P<0.05)。LOC387715/ARMS2 rs10490924与湿性AMD显著相关:ORhom10.76(5.14~22.52),ORhet=3.40(1.79~6.44),纯合子等位危险基因危险度高于杂合子。5、HTRA-1 rs11200638:健康对照组:基因型分布为GG占30%,GA 47.9%,AA 22.1%;等位基因分布频率为G 53.9%,A 46.1%。Hardy-Weinberg平衡定律检验χ2=0.191,P=0.622。湿性AMD组:基因型分布为GG 8.2%,GA 30%,AA 62.3%;等位基因分布频率为G 23%,A 77%。Hardy-Weinberg平衡定律检验χ2=4.294,P=0.04。P>0.05说明群体基因遗传平衡,数据来自同一孟德尔群体。HTRA-1 rs11200638基因型在湿性AMD患者与健康对照组中的分布有显著性差异,χ2=53.38(P<0.05),A等位基因频率在湿性AMD患者(77%)与健康对照组(46.1%)的分布有显著性差异,χ2=36.13(P<0.05)。HTRA-1 rs11200638与湿性AMD显著相关:ORhom=2.27(1.10~4.68),ORhet=10.32(4.92~21.66)。6、单倍型关联分析:对CFH三个SNP位点进行的单倍型分析结果显示,包含以上三个位点突变等位基因的单倍型TGC与湿性AMD的发生显著相关(OR=3.033,95%CI 1.512~6.084),但是各基因位点之间仅存在弱的连锁不平衡(D’<0.5,r2<0.3)。对LOC387715/ARMS2 rs10490924和HTRA-1 rs11200638进行的单倍型分析结果显示,单倍型TA有显著增加湿性AMD风险的作用(OR=3.316,95%CI 2.05~5.36),两基因位点间存在强连锁不平衡(D’=0.96,r2=0.86)。【结论】1、中国北方人群CFH(Y402H rs1061170、-257C>T rs3753394、IVS15rs1329428)、LOC387715/ARMS2 rs10490924、HTRA1 rs11200638 SNP位点具有多态性,Y402H rs1061170 C/T多态性、-257C>T rs3753394 T/C多态性、IVS15rs1329428 G/A多态性、LOC387715/ARMS2 rs10490924 G/T多态性、HTRA-1rs11200638 G/A多态性可能与中国北方地区人湿性AMD疾病发生发展相关,是其易感危险因素之一,其相关性可为湿性AMD的预防和治疗提供新的方案。2、CFH Y402H rs1061170、-257C>T rs3753394及IVS15 rs1329428基因位点之间仅存在弱的连锁不平衡(D’<0.5,r2<0.3),不能证明以上三个基因位点位于一个单倍域内。LOC387715/ARMS2 rs10490924和HTRA-1 rs11200638基因位点间存在强连锁不平衡(D’=0.96,r2=0.86),其单倍型TA有显著增加湿性AMD风险的作用(OR=3.316,95%CI 2.05~5.36)。3、本研究在进一步揭示中国北方人湿性AMD的发病机理方面有一定的作用,为湿性AMD的预防和治疗提供了一定的理论依据。
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