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蛱蝶科(Nymphalidae)蝶类是鳞翅目(Lepidoptera)昆虫中的一个重要类群。然而,和其他主要蝴蝶类群相比,长期以来对它的系统学研究相对滞后。其起源、系统发生尤其是蛱蝶科内部主要分类群间的系统发生关系尚存在一些有争议的难题。基于形态学性状的分析,国内外关于蛱蝶科的分类体系间还存在明显差异,国外分类系统涵盖了较多的蝶类类群。近年来,由于分子生物学在蛱蝶科系统分类中的广泛应用,蛱蝶科各主要类群间系统发生关系的格局逐步清晰,但国内蛱蝶科的分子系统学研究还十分匮乏。本文首先就蛱蝶科形态学特征和系统学研究进展在蛱蝶科中的应用作了简要的评述。本文测定了蛱蝶科7亚科27种蛱蝶和斑蝶科2种蝴蝶的线粒体16S rRNA和12S rRNA基因部分序列。从GenBank中下载了6种蛱蝶的16S rRNA基因同源序列,通过遗传分析软件对16S rDNA、12S rDNA部分序列和两者组合序列进行了比较分析;以斑蝶科的蝶类做外群,以邻接法和贝叶斯法重建了蛱蝶科主要类群的分子系统树,探讨了它们之间的系统发生关系。序列分析的结果显示:经比对处理后16S rDNA有494 bp,其中有可变位点206个,简约信息位点145个;A+T平均含量78.4%; 12S rDNA序列长度为514bp,其中有可变位点166个,简约信息位点123个, A+T平均含量86.1%;联合序列长度为1037bp,其中有可变位点369个,简约信息位点261个,A+T平均含量82.6%;碱基组成均出现A、T偏倚性。12S、16S和组合序列中各种碱基替换类型速率不同,三者的核苷酸的替代转换均高于颠换。分子系统树显示:蛱蝶亚科并非单系群,蛱蝶族中眼蛱蝶属应移入斑蛱蝶族;豹蛱蝶亚科为单系发生;闪蛱蝶和苾蛱蝶亚科与蛱蝶亚科具有较近的系统关系;支持将秀蛱蝶和苾蛱蝶亚科从线蛱蝶亚科中分离出来。另外,三种分子证据所构建的系统树也显示出不同的结果:基于16S rDNA的分子系统树支持豹蛱蝶和釉蛱蝶合为一亚科即釉蛱蝶亚科;12S rDNA的分子系统树显示苾蛱蝶、秀蛱蝶、闪蛱蝶与豹蛱蝶+线蛱蝶亚科具有较近的亲缘关系;联合序列系统树显示线蛱蝶亚科是一单系群,豹蛱蝶亚科与线蛱蝶亚科构成姐妹群,秀蛱蝶亚科的电蛱蝶同豹蛱蝶+线蛱蝶亚科这一支系聚类,螯蛱蝶中的二尾蛱蝶是蛱蝶科其它类群的基部分支。