辣椒属于茄科辣椒属一年生或多年生植物,是我国五大蔬菜作物（番茄、黄瓜、甘蓝、白菜、辣椒）之一。辣椒的主要食用器官是果实,其营养丰富,维生素C含量居蔬菜之首,辣椒中的胡萝卜素、维生素B1、B2、B5等含量相当高,辣椒还含有辣椒碱、二氢辣椒碱、香荚兰胺等辛辣物质;含隐黄素、辣椒红素、辣椒玉红素等色素物质以及柠檬酸、酒石酸、苹果酸等有机酸。中国具有丰富的辣椒资源,但长期以来这些资源没有得到有效利用,主要是缺乏对这些资源的系统挖掘和深入了解。本研究建立了紫色辣椒凤紫1号的再生体系,同时对该试材以及其它20份辣椒材料进行了遗传多样性分析,拟在分子水平上明确这些资源的遗传基础,为今后更加合理有效地利用提供技术支撑。1.紫色辣椒再生体系的建立凤紫1号腋芽诱导的最佳外植体为4叶1心期,在研究范围内其腋芽诱导的最适激素组合为MS+B₅（有机物）+6-BA6.0mg/L+NAA0.1 mg/L最佳蔗糖浓度是20g/L;腋芽增殖时,激素6-BA与NAA的组合优于6-BA与IBA的组合,其最佳激素组合为6-BA6.0mg/L+NAA0.1 mg/L,增殖倍数达2.42倍;基本培养基种类显著影响腋芽的生根,生根最佳激素组合为1/2MS+ IBA0.5mg/L,最高生根率可达62.5%;基质对腋芽移栽成活的影响较大,其中,河沙:珍珠岩:泥炭土（1:1:3）的基质中,试管苗成活率最高,为96.7%。2.种质亲缘关系分析本试验用CTAB法提取21份不同品种辣椒的DNA,浓度达20-50ng/5ul,并进行RAPD分析。从100个10bp的引物中筛选出15个能扩增出清晰条带的引物,共扩增出103条带,其中,多态性条带有82条,多态带比率为79.61%。对21份辣椒品种进行亲缘关系鉴定可知,当遗传距离为0.68923时,所有21份辣椒品种可聚为一大类;当遗传距离为0.16854时,黄皮甜椒和汴椒1号首先聚在一起。当遗传距离为0.5122时,辣椒被分为5类。第一类中包括14个品种,可分为三个亚类,第一亚类既包括线椒,也包含长椒和甜椒,并没有形成与其形态学分类相似的聚类;而只有凤紫1号的第三亚类,在分子标记水平和形态学方面都与其它辣椒品种有着明显的差异,有望成为优良的育种材料。第二类为桔西亚、多米、黄欧宝等3个从国外进口的彩色甜椒品种;第三类为2个朝天椒品种,其味辣果小簇生。第四类和第五类都只有一个种质,分别是为来自甘肃的品种七寸红和贵州的品种贵海香。