枇杷(Eriobotrya japonica Lindl.)DELLA基因的克隆与分析

来源 :西南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:maoloye
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
DELLA蛋白位于植物细胞核中,在GA信号传导过程中起阻遏作用,还广泛参与植物光形态建成、环境信号传导和激素生长调节反应等生理过程。国内关于DELLA蛋白相关基因的研究起步较晚,但受到研究者的高度重视。近年来,获得了玉米GA受体基因、拟南芥DELLA下游的GASA基因家族、水稻SLR1基因、茄子SmGA噬因、海岛棉GhRGL(RGL-LIKE)基因等一批DELLA蛋白基因,并开展了载体构建、基因表达和功能分析等相关研究。目前,尚无枇杷DELLA蛋白相关基因的研究报道。本研究采用同源基因序列克隆方法对不同品种、同一品种不同倍性的枇杷进行DELLA基因克隆,再通过RACE扩增扩其全长,并进行序列比对分析。同时通过RT-PCR扩增对枇杷DELLA基因的表达进行初步分析。为继续开展枇杷DELLA蛋白的功能鉴定、时空表达分析等进一步研究奠定基础。本论文主要研究结果如下:(一)枇杷DNA和RNA提取方法改良利用CTAB改良方法Ⅰ、CTAB改良方法Ⅱ提取基因组DNA和改良CTAB-LiCl沉淀法提取RNA,提取的核酸质量较高,基本克服了多糖、多酚等杂质的影响,可以满足基本分子生物学实验的要求,保证后续试验的顺利进行。(二)枇杷1DELLA基因同源序列克隆1、利用正交试验设计筛选得到PrimeSTARTM HS DNA Polymerase特异引物PCR扩增产物的最优体系5×PrimeSTARTM Bufferd(含Mg2+) 3μL, dNTP Mixture (各10 mmol/L)1.6μL,上游引物(10 mmol/L)0.4μL,下游引物(10 mmol/L)0.4gL,模板DNA/cDNA (20ng/μL) 0.4μL, PrimeSTARTM HS DNA Polymerase (2.5 U/μL) 0.2μL,加灭菌去离子水补足20μL。2、根据GeneBank中登录的苹果DELLA蛋白基因序列设计了一对简并引物,对“大五星”(A)和“龙泉1号”(B)基因组进行PCR扩增克隆,得到长度都在700bp左右的片段,其中“大五星”条(暂命名为Sequence A1-A3,“龙泉1号”三条(暂命名为Sequence B1-B3), BLAST比对发现与苹果属DELLA基因的同源性达90%以上,全为外显子序列,无内含子。3、根据“龙泉1号Sequence B3设计特异引物,对“龙泉1号”二倍体、三倍体的gDNA和cDNA进行PCR扩增,得两条特异片段,片段长度都为731bp。通过BLAST比对,其中为一条与SequenceB3序列一致.另外一条与SequenceB3同源性达94%,存在单核苷酸变异,暂命名为SequenceB3a,经同源性比对均为DELLA基因片段。4、根据SequenceB3a基因序列片段设计RACE扩增引物进行RACE扩增,得到3’端464bp的序列,在Genbank上经过BLAST分析,发现该片段与苹果属MdRGL3a (GenBank登录号:DQ007887)同源性为97%,与MdRGL3b (GenBank登录号:DQ007888)同源性为92%,表明为DELLA同源基因序列。(三)枇杷DELLA基因序列分析1、比对枇杷不同品种的DELLA基因片段,发现”大五星”和”龙泉1号”6条序列彼此之间的同源性都超过60%。两个品种之间的3条DELLA基因序列都存在着多个核苷酸差异,而单个品种的3条基因序列之间也存在着核甘酸差异。2、比对枇杷同一品种不同倍性的DELLA基因片段,发现从“龙泉1号”二倍体gDNA中克隆得到SequenceB3和SequenceB3a两条序列,而cDNA中只克隆得至SequenceB3a。龙泉1号”三倍体gDNA和cDNA中都克隆得到这两个序列,据此推测二倍体中SequenceB3发生了基因沉默,而三倍体中均得到表达。3、将克隆得到的7条基因片段同Genebank上已经登录的蔷薇科苹果属DELLA蛋白基因序列一起构建分子进化树,发现该进化树分成三个大的进化分支,枇杷7条序列分散在其中。4、RACE扩增拼接得到“龙泉1号”SequenceB3a cDNA 3’端核甘酸序列,长度为1095 bp,包含终止密码子TAA,还包含了对应3’端的一段不翻译区。该序列的有效翻译区长度为915bp,翻译该DELLA蛋白C端序列304个氨基酸。分析发现枇杷DELLA蛋白C端氨基酸序列与其它已报道物种的DELLA基因高度同源,包含C端VHIID、RVER和SAW保守结构域。用BioEdit等软件对该序列编码蛋白结构与功能进行了预测。(四)枇杷DELLA同源基因表达的初步分析利用半定量RT-PCR的方法对“龙泉1号”二、三倍体的叶片和初花期、露白期、盛花期、花末期四个时期花器官1DELLA同源基因的表达进行了初步研究,结果表明,无论是二倍体还是三倍体DELLA基因在各个器官中都有表达,同一发育时期,三倍体中DELLA基因的表达水平比二倍体高。三倍体(?)DELLA基因在上述四个时期花器官的表达量逐渐增大。与二倍体相比,末花期DELLA蛋白表达明显增加。
其他文献
由于科学技术的发展,尤其是现代信息技术与互联技术的突破,使得传统图书馆的发展也走向了智慧化的发展轨道,智慧图书馆不但是技术上的进步,更是服务上的提升,尤以个性化推荐
职业技能竞赛“以赛促教”“以赛促学”的特点,有效推动应用型本科教育教学改革,提升专业技能人才培养质量.充分认识职业技能竞赛对地方本科院校旅游烹饪类专业常规教学改革
少年强,则国强,一个国家要想发展壮大,年青一代是国家发展主力军.我国高度重视国家教育体系,尤其是高职教育和本科教育,因为二者在教育体系和人才培养方面有着本质的区分.目
棉花早衰是制约棉花平衡增产的因素之一,特别是近几年来,棉花早衰的面积不断扩大,产量损失逐年增加,据调查,早衰棉田一般减产5~40%,平均每亩减收皮棉12.6公斤左右。为此我们
12个无籽西瓜高世代自交系分成两组,6个母本,6个父本,对12个无籽西瓜品种36个组合13个数量性状进行配合力及遗传力分析、遗传主成分分析、遗传距离分析;筛选出综合性状良好的无籽
CD4+CD25+ T cells play a major role in modulating immune response, but few reports have been published about schistosomiasis. Here, we investigated the changes
To identify genes associated with morphological phenotypes of human bladder transitional cell carcinoma, we used suppression subtractive hybridization (SSH) to
In order to investigate porcine heterosis on the molecular basis, Large White (L), a European purebred, and Meishan (M), a Chinese indigenous purebred, were hyb
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
“三农”问题一直以来都是摆在我国社会主义建设事业面前的严格重要工作任务.尤其是在我国大力构建城镇化的背景下,如何在城乡统筹发展的基础上,促使城乡统筹事业朝着更好的