崆峒山位于陇东黄土高原的西部，是多种植物区系的交汇处，区系成分复杂，联系广泛。据调查统计，本区有野生种子植物88科345属680种。通过对崆峒山种子植物区系的组成、性质的分析讨论，崆峒山的植物区系特征为： 1．崆峒山地区种子植物种类丰富，地理成分复杂，联系广泛，温带成分占绝对优势，为典型的北温带性质。 2．植物区系具有明显的过渡性，是多种植物区系的交汇点，但以中国—日本成分为主。 3．华北成分是崆峒山分布的中国特有种中的主要成分，其次是横断山成分。 4．本区系中年轻成分占较大优势，古老成分很少，植物区系是随第三纪喜马拉雅造山运动及六盘山隆起逐步形成和发展起来的。 5．无论是科、属、种三个水平上的相似性系数比较，还是聚类分析结果，都反映了本区系和六盘山植物区系关系最近，联系最为密切，其次是兴隆山、小陇山和祁连山。 6．本区系特有性程度低，有3个中国特有属，无本地区特有科和属，特有种(变种)仅有4个。 7．本区系种子植物的组成成分、物种配置、群落生境和资源植物的多样性丰富。 8．根据种、中国特有种和建群种的分布情况及自然地理特征，本区系应隶属于：泛北极植物区、中国—日本森林植物亚区、华北地区、黄土高原亚地区。