Brachyury(T-box)基因对调控哺乳动物胚胎发育,尤其是脊索的形成发育发挥着重要作用,缺乏Brachyury蛋白的哺乳动物胚胎不能正常发育,使动物尾部表型非正常化。为了揭示Brachyury(T-box)基因与呼伦贝尔短尾羊短尾性状潜在的作用关系。利用Sanger测序技术对比子代呼伦贝尔短尾羊与亲代和乌珠穆沁羊的Brachyury(T-box)基因的基因型;利用X光拍照及尾椎标本的制作对比呼伦贝尔短尾羊与乌珠穆沁羊尾部形态特征;利用亚硫酸氢盐测序法检测Brachyury(T-box)基因的甲基化情况。实验得到如下结果:1.呼伦贝尔短尾羊自交子代的Brachyury(T-box)基因自起始密码子第c.G333C,c.G334T位点基因型与亲代相同,与乌珠穆沁羊不同;2.呼伦贝尔短尾羊尾椎长度,节数均短于,少于乌珠穆沁羊,且存在畸形;3.呼伦贝尔短尾羊与乌珠穆沁羊Brachyury(T-box)基因的启动子序列甲基化程度分别为:2.50%,8.33%,在CpG岛预测位点的-97-,-118-位点甲基化水平差异显著;第二外显子序列的甲基化程度分别为:43.48%,27.39%,在序列CpG岛预测位点的-167-,-175-,-188-,-224-,-245-,-299-,-314-位点甲基化水平差异显著。本研究结合实验室前期研究成果进一步探究了呼伦贝尔短尾羊短尾表型的分子机制,发现Brachyury(T-box)差异型基因能够稳定遗传,分析了表观遗传信息,为验证差异基因做了准备。为验证Brachyury(T-box)基因的功能研究和呼伦贝尔短尾羊的分子育种提供理论依据。