青稞查尔酮合酶基因的克隆与原核表达

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青稞(Hordeum vulgare L. var. nudum Hook. F)是我国青藏高原地区对多棱裸粒大麦的统称,即裸大麦。青稞不仅属于“三高两低”(高蛋白、高纤维、高维生素、低脂肪和低糖)食品,更含有丰富的功能活性成分如黄酮类化合物、γ-氨基丁酸、多酚类化合物、B族维生素以及β-葡聚糖等,这些营养物质对人的身体具有保健作用。随着人民生活水平的提高,青稞的营养价值亦受到更加重视。黄酮是植物中一类重要的次生代谢产物,具有抗氧化、清除自由基、提高免疫力、防止骨质疏松、保护肝脏等药理作用,是人们的理想保健物质。黄酮在植物中主要有黄酮、黄酮醇、黄烷酮、异黄酮等十几类,青稞中主要以黄酮醇为主。查尔酮合酶(CHS)为黄酮代谢途径的第一个关键限速酶,广泛分布在植物界,并且在植物的生长和适应环境活动中起着重要作用,近年来也成为分子生物学及植物生理学的研究热点之一。为了了解黄酮代谢途径中相关酶基因的作用,本实验以青稞“94-19-1”为材料,采用同源克隆的方式,克隆出了青稞查尔酮合酶基因的编码序列(Coding sequence,CDS)全长,并构建载体pET-32a-HvCHS,进行原核表达得到了其融合蛋白。本实验主要结果如下:1.采用同源克隆的方法获得了青稞CHS的CDS全长序列,全长为1351 bp,该序列包含一个完整的开放阅读框(ORF)1197bp,该ORF编码398个氨基酸。序列分析表明:该基因编码蛋白分子量43.4 KDa,等电点为预测等电点(PI)为5.92,是酸性蛋白,该酶蛋白的不稳定系数(Ⅱ)为40.10(大于40),属于不稳定蛋白,预测其半衰期为30 h,平均亲水指数为-0.090,是亲水性蛋白。2. Blastn对比分析结果表明:该全长序列与大麦同源性最高,达到99%,与普通小麦同源性为91%;与水稻同源性为88%。与玉米同源性为85%;与高粱同源性为78%;与葡萄、矮牵牛、橄榄、马铃薯、西红柿等已知的CHS基因的同源性在65%-74%之间。进一步构建系统进化树显示青稞与单子叶植物的大麦、普通小麦的亲缘关系最近,相对双子叶植物如西红柿等关系较远。3.使用在线服务器PHYRE2 Server结合SOPMA软件对HvCHS酶蛋白的二级结构进行预测,发现HvCHS酶蛋白的二级结构主要由α-螺旋(41%)、无规则卷曲(12%)、及β-转角(15%)组成。进行蛋白质的N-糖基化和N-磷酸化预测,没有发现糖基化位点,却具丰富的磷酸化位点,9个丝氨酸(Ser)、6个苏氨酸(Thr)和2个酪氨酸(Tyr)存在磷酸化活性位点。4.将青稞CHS基因的编码序列与表达载体pET-32a连接后在大肠杆菌BL21中进行原核表达,发现CHS基因编码的蛋白与pET-32a表达载体上的标签蛋白形成64 KDa左右的融合蛋白。对其表达条件进行优化,发现融合蛋白最佳IPTG诱导浓度为1.0 mM,最佳诱导时间为3 h。
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