人类乙醇脱氢酶1A的生物信息学分析及在肺癌中的功能分析

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研究背景:目前全球癌症发病率和死亡率正在迅速增长,造成全球严重的健康负担。其中,肺癌是最常见的癌症和癌症相关死亡的主要原因。已有研究报道乙醇脱氢酶A(ADH)基因家族中的ADH1基因在包括肺癌在内的多种实体瘤中均发挥着重要作用。ADH1基因包括三个基因型ADH1A、ADH1B以及ADH1C,目前关于ADH1A在肿瘤中的研究甚少,所以本研究选取了 ADH1A作为ADH1的代表基因,探讨其在各种实体瘤,特别是肺癌中的作用,以进一步地了解肿瘤的发生发展过程,并为进一步研究提供理论基础。方法与材料:通过GTEx数据库、TCGA数据库在RNA水平上初步探索ADH1A在人类正常组织和多种实体瘤中的表达,随后收集38例肿瘤患者的肿瘤和正常组织,收集5只雄性BALB/c小鼠组织,进行免疫组化分析以探索ADH1A在蛋白质水平上的差异分布。利用基因差异共表达分析、主成分分析、功能富集分析、免疫浸润分析以及生存分析等方法探索ADH1A在肿瘤组织发挥的功能,并采用多个miRNA数据库及转录因子数据库预测并构建出ADH1A在肺腺癌中的上游调控网络及其下游互助蛋白网络。结果:在RNA水平上,ADH1A主要在肝脏中表达,但在蛋白质水平上,ADH1A在人体消化系统(如肝,胃,结肠或直肠)以及部分呼吸系统和泌尿系统的正常组织中的表达量要高于肿瘤组织,提示ADH1A在这些肿瘤中存在潜在的诊断价值。生存分析提示ADH1A在乳腺癌、胰腺癌、肺腺癌中均存在潜在的预后价值。我们发现ADH1A存在三个主要保守功能,包括血管生成、细胞黏附和白细胞迁移功能,我们推测白细胞迁移功能可能影响着免疫细胞对肿瘤组织的浸润,并可能影响免疫治疗的疗效。在此基础上,我们进一步探讨了 ADH1A在肺腺癌和肺鳞癌中的功能差异及其对患者预后的影响,并构建了肺腺癌中ADH1A的上游调控网络和下游蛋白作用网络。此外,BALB/c小鼠的免疫组化结果提示,在建立研究ADH1A的胃腺癌,食管癌,肝细胞癌和前列腺癌的动物模型时,BALB/c小鼠可能是个不错的选择。结论:ADH1A在包括肺腺癌在内的多种实体瘤中具有潜在的诊断价值和预后价值。我们的发现为进一步研究ADH1A生物学过程提供了理论基础,并为免疫疗法提供了一种潜在的预后生物标志物。
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