抗CRISPR系统的小分子抑制剂

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铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)和化脓链球菌(Streptococcus pyogenes)是临床上很重要的两种细菌。铜绿假单胞菌虽然致病力较低,但有较强的耐药性;化脓链球菌则会导致各种化脓性炎症,猩红热,丹毒,新生儿败血症,脑膜炎,产褥热以及链球菌变态反应性疾病等疾病。近年来,抗生素滥用的情况盛行,导致产生了临床耐药菌,为解决这一问题,本论文采用新思路,通过找到能够抑制细菌的适应性免疫系统——CRISPR系统中的重要核酸酶活性的小分子化合物,提高细菌对噬菌体的敏感性,从而达到利用噬菌体治疗耐药菌感染的目的。
  本论文研究结果显示,通过在体外表达与纯化三种蛋白,分别得到约1.5mg/mL的蛋白液,将纯化得到的蛋白液与相对应的核酸底物进行酶促反应,并用PAGE胶进行分离,可见被切开的底物条带,由此可以证明纯化得到的蛋白是具有酶活性的。通过在核酸底物上标记荧光基团,本文中构建了高通量的药物筛选模型,并随后利用此模型对天然产物库中的化合物进行药物筛选。
  利用本文中构建的高通量筛选模型进行筛选,可以得到13种抗Cas3的化合物,26种抗Cas6的化合物以及5种抗Cas9的化合物。为进一步对初筛得到的化合物进行复筛,本文中对上述化合物与对应核酸酶进行分子互作试验,结果显示,有2种化合物与Cas3存在相互作用,8种化合物与Cas6存在相互作用。
  结论:前期试验中纯化得到的蛋白具有明显的酶活性,为后续的高通量筛选奠定了基础。在体外试验中,来源于铜绿假单胞菌的Cas3和Cas6蛋白,分别能够被2种和8种化合物抑制。
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