马铃薯疮痂病(Potato common scab)是由植物病原链霉菌引起的经济性病害。目前该病害在中国各马铃薯产区均有不同程度发生，特别是在微型薯的生产过程中，发病较为严重。本研究对马铃薯疮痂病菌进行了抑菌药剂筛选、温室微型薯防治试验及防治后蛭石基质中微生物的变化分析，旨在了解疮痂病防治后基质中微生物组成的变化情况，为探索马铃薯疮痂病的生物防治机制奠定基础。　　采用纸碟法对29种不同药剂室内抑菌筛选结果表明:对疮痂病菌4个不同致病种均有抑菌效果的药剂为72％农用链霉素、咯菌腈、百菌清、福美双、四霉素、氰烯菌酯、三唑酮和亿度勇。其中对疮痂病菌S.scabies致病种菌株CPS-1抑菌效果较好的药剂为农用链霉素、咯菌腈、百菌清和福美双。微型薯防治试验结果表明，使用生防菌ZWQ-1、咯菌腈、四霉素、福美双处理后对马铃薯疮痂病的防治效果分别为33.26％、72.60％、57.92％和24.75％。　　将不同防治处理的蛭石基质进行取样并提取基因组后，利用lllumina Miseq高通量测序技术进行分析。结果表明:不同处理间微生物优势菌群的组成和含量变化较大。其中细菌的优势菌群变化中，生防菌ZWQ-1处理中链霉菌属的含量比对照组少3.0％，假单胞菌属的含量比对照组多5％;咯菌腈处理中链霉菌属的含量比对照组少3.5％，假单胞菌属的含量比对照组多11.6％，黄单胞菌属的含量比对照组少4％;福美双处理中链霉菌属的含量比对照组少3.2％，假单胞菌属的含量比对照组多29.5％，黄单胞菌属的含量比对照组少3.2％;四霉素的处理中假单胞菌属的含量比对照组多32.2％，苯基杆菌属的含量比对照组多4.7％。真菌的优势菌群变化中，生防菌ZWQ-1处理中明梭孢属的含量比对照组少30.2％，蛙粪霉属的含量比对照组少8.5％，枝顶孢属的含量比对照组少12％，曲霉属含量比对照组少4.5％;咯菌腈处理中明梭孢属的含量比对照组少30.9％，枝顶孢属的含量比对照组少5.8％，曲霉属含量比对照组少4.4％;福美双处理中毕赤酵母属的含量比对照组多7.9％，明梭孢属的含量比对照组少28.6％，蛀粪霉属的含量比对照组少12.1％，枝顶孢属的含量比对照组少5.9％，曲霉属含量比对照组多5.6％;四霉素的处理中毕赤酵母属的含量比对照组多30.5％，明梭孢属的含量比对照组少31.8％，蛙粪霉属的含量比对照组少11.8％，枝顶孢属的含量比对照组少11.4％，曲霉属含量比对照组少2.2％。　　对本研究各处理的结果进行比较后发现，在防治效果较好的处理中，链霉菌属、假单胞菌属、明梭孢属的含量有明显变化。细菌的优势菌属中链霉菌属、假单胞菌属的含量减少，黄单胞菌属、苯基杆菌属的含量增加;真菌中的优势菌属中毕赤酵母属的含量增加，明梭孢属、蛙粪霉属、枝顶孢属的含量减少。