内部控制审计是指注册会计师对企业内部控制实施的专门的审计程序,对特定日期的企业内部控制的有效性进行审计,并发表审计意见。它的产生和发展同全球资本市场的发展是紧密相关的。从本世纪初开始,美国安然公司爆发了惊人的财务舞弊丑闻,直接导致百年信誉的安达信会计师事务所破产。紧接着,美国世通、欧洲维旺迪等一些著名的公司也相继爆发了财务丑闻。这一系列数额惊人的财务舞弊案件,对资本市场产生极大震动,同时也引起了会计界、政府监管机构、民间组织和社会公众的强烈关注,大家从不同的角度对这一系列的事件进行了深刻的反思,社会各方认为其中有一重要原因就是内部控制制度的失灵以及内部控制审计制度的缺失。在整顿资本市场秩序,挽回社会公众对资本市场的信心方面,美国又一次走在了世界的前面。2002年颁布了《萨班斯—奥克斯利法案》,该法案要求管理层在对外披露财务报告的同时也要提交一份内部控制的评价报告,还要求公司内部控制必须经注册会计师审计。随后,其他发达国家也相继效仿美国并根据各国实际情况制定了内部控制审计的相关法律法规。我国2008年由五部委联合发布了《企业内部控制基本规范》,标志着我国即将开展内部控制审计业务。2010年4月15日,《企业内部控制应用指引》、《企业内部控制评价指引》及《企业内部控制审计指引》同期发布。《规范》要求上市公司和非上市大中型企业应当对本公司内部控制的有效性进行自我评价,披露年度自我评价报告,同时上市公司应当聘请具有证券、期货业务资格的中介机构对内部控制的有效性进行审计,出具内部控制审计报告。2011年8月23日,中注协发布《企业内部控制审计指南(征求意见稿)》,公开向行业征求意见。今年,证监会在上市公司中也公布了进行内部控制审计试点的企业,将积极推进上市公司内部控制审计的开展。内部控制审计这一新型业务的开展将会对提高财务报告信息质量,预防上市公司财务舞弊方面产生深远影响,这也正是本文研究内部控制审计问题的价值所在。本文在对国内外内部控制审计相关文献及其发展历程研究的基础上,对内部控制审计的相关概念进行了界定,结合国内外内部控制审计的发展,分析了我国内部控制审计发展存在的不足,提出了改进的建议。本文重点介绍了在整合审计框架下内部控制审计的流程,并且从财务报表审计和内部控制审计的审计目标整合出发,从审计计划的整合,审计实施的整合和审计报告整合三个方面分析了整合审计。本文的主要创新点及其结论如下：(1)完善了内部控制审计流程,引入了内部控制审计风险模型。通过研究PCAOB的财务报告内部控制审计准则,并结合其他研究成果,并结合对《企业内部控制审计指引》和《企业内部控制审计指南》(征求意见稿)的理解等其他研究成果的理解,设计了一套适合我国的内部控制审计流程,完善了内部控制审计流程,规范了审计程序,优化了审计方法,有助于注册会计师将主要精力集中于风险最大的领域。所设计的流程主要包括：审计计划、选择控制点、控制测试、评价控制缺陷、审计工作总结和出具内部控制审计报告等程序,并明确指出应采用自上而下的审计方式。并且借鉴了财务报表审计风险模型,在内部控制审计中引入了内部控制审计风险模型。(2)注册会计师对于同一被审计单位既进行内部控制审计又进行财务报表审计,二者有很多的共同点,提出旨在实现内部控制审计目标的具体实施策略—整合审计,并制定出相应的操作步骤。将审计计划阶段、实施阶段和报告阶段的整合实施过程在一家上市公司模拟运用,以检验其可行性,为注册会计师在实务操作中明确路线。本文主要分五个章节进行叙述：第一章绪论部分包括研究目的与意义,文献综述等,提出了本文的研究方法和可能的创新点。在这一章中介绍了前辈们的研究成果和不足之处,明确了本文的研究目的和方向。第二章主要介绍内部控制审计的基础理论,包括内部控制审计的发展历程和内部控制审计的有关概念,界定本文研究的理论依据。这一章是本文的理论部分,明确了本文的研究范围。第三章主要介绍国外内部控制审计发展及对我国的启示,从国外发达国家内部控制审计的发展出发,讨论了我国内部控制审计存在的问题,论述了我国应从国外发达国家吸取的经验。第四章主要在借鉴其他国家的经验,结合我国的实际国情,设计和完善了我国内部控制审计应当采用的流程,分别从计划、实施和完成三个方面来阐述,并且引入了内部控制审计风险模型。第五章主要介绍在成本效益原则的约束下,整合审计在内部控制审计中的提出及应用。为我国注册会计师开展内部控制审计工作提供了新的思路。同时,本文也存在以下不足：第一,我国有关内部控制审计的相关的准则体系还在完善之中,我国的内部控制实践也刚刚开展,因此,笔者在具体准则的参考方面,主要以我国内部控制审计指引、相关的征求意见稿、美国PCAOB第五号审计准则等。这些准则在中国实施能否适应中国国情还有待检验。第二,本文的研究范围只是财务报表内部控制审计进行了讨论与阐述,也只对企业内部控制整体有效性发表意见,范围比较窄。