苹果煤污和蝇粪病是苹果生产过程的重要病害,严重影响果实外观。主要表现为果面呈现深色煤烟状脏污,或着生轮纹状排列的黑色小点。苹果煤污和蝇粪病具有症状多样,如煤烟状、颗粒状、分枝状、蜂巢状等,和病原复杂的特点。对分离自中国苹果主产区的煤污和蝇粪病病原菌采用形态鉴定和核糖体DNA的ITS(内转录间隔区)序列分析相结合的方法对其多样性进行了分析,并利用BsuRⅠ和MspⅠ两种限制性内切酶进行了ITS片段的PCR-RFLP(限制性片段长度多态性分析),为该类病原菌的快速鉴定提供了依据。通过形态、酶切和序列分析三种方法的分析得到了一致的结果,说明利用这两种内切酶对该类病原菌进行分析鉴定具有很好的分辨率。通过本论文的研究描述了三个新种,即苹果锥梗孢Dissoconium mali、梗多隔锥梗孢Dissoconium Conidiophora-multiseptatae及苹果横断孢Strelitziana mali;建立了该类群病原菌的BsuRⅠ和MspⅠITS片段酶切图谱;并通过ITS区序列测定构建系统发育树进行分析将各菌株进行了归属和鉴定。经过对苹果煤污和蝇粪病病原菌多样性进行分析发现其主要分布在子囊菌门座囊菌纲Dothidiomycetes和刺盾炱纲Chaetothyriomycetes的3个目11个属和担子菌门的节担菌纲Wallemiomcycetes,节菌属Wallemia中,,显示了苹果煤污和蝇粪病病原菌具有相当的复杂性。