狗獾(Meles meles)属于鼬科(Mustelidae),狗獾属(Meles),为中小型穴居动物。该物种广泛分布于欧亚大陆,具有极强的环境适应能力。先前的研究已经表明了狗獾在野生环境和圈养环境下生理活动均存在明显的季节性差异。为了从基因表达层面了解圈养狗獾不同时期的差异,我们对夏季(8月)和冬季(2月)狗獾的肝脏和白色脂肪组织进行了转录组测序。主要结果如下:(1)我们使用RNA-seq技术对夏季和冬季各3只圈养狗獾的肝脏和白色脂肪组织进行了测序。在对原始数据进行过滤之后,每个样本得到了6.19Gb到8.63Gb的clean reads。我们对所有样品进行De nove组装,一共得到了254659条unigenes,N50和平均长度分别为2617bp和1115bp。之后对unigenes进行功能注释和分析,有117165个unigenes在Nr数据库中注释成功,占总unigenes数目的46%,有28428个(11.16%)unigenes在所有数据库中都得到了注释。GO注释结果显示,87358条unigenes被分类到生物学过程、细胞组分和分子功能三大类中。KEGG分析结果显示69883个unigenes被注释到232条KEGG代谢通路中。KOG分析结果显示43863个unigenes被划分到26个KOG类中。(2)我们使用DESeq程序进行差异表达基因的筛选。我们从肝脏组织中筛选到405个差异表达基因,其中有225个基因在夏季肝脏组织中上调,180个基因在冬季肝脏组织中上调。从白色脂肪组织中筛选到366个差异表达基因,其中有210个基因在夏季白色脂肪组织中上调,有156个基因在冬季白色脂肪组织中上调。基于差异表达基因我们分析了圈养狗獾在不同季节的压力响应,我们发现热休克蛋白等与压力相关的基因在夏季上调表达,这提示狗獾在夏季可能面临更多的压力。(3)GO功能富集分析结果显示,在肝脏组织中,冬季上调表达的基因的显著富集到脂肪酸生物合成过程、细胞酮体代谢过程、ATP代谢过程等GO terms中。在白色脂肪组织中,冬季上调表达的基因显著富集到脂肪酸代谢过程、脂肪酸生物合成过程和分泌等GO terms上。KEGG通路富集分析显示,在冬季肝脏组织中上调表达的基因显著富集到脂肪酸生物合成、酮体的合成和降解、胰高血糖素信号等通路。在白色脂肪组织中,冬季上调表达的基因显著富集到包括脂肪酸生物合成、胰岛素信号通路、脂肪细胞因子信号通路、胰岛素抵抗等在内通路。这表明圈养狗獾在不同季节的能量代谢、脂质代谢以及血糖调节等方面存在一定的差异。本研究通过对狗獾进行转录组测序和分析,获得并注释了大量的功能基因,同时初步阐述了不同季节圈养条件下狗獾压力响应和代谢的差异。本研究的结果为进一步理解哺乳动物适应季节变化提供了新的见解,也为狗獾的养殖提供一定的科学依据。