由于灾后重建，基本建设工程项目多、范围大、时间紧，政府审计部门委托审计的审计形式普遍存在，虽然加快了审计工作尽早结束的步伐，但是也带来了严峻的考验。工程项目竣工结算审计工作处在一个不够规范的阶段，导致审计结果不能忠实反映工程的实际造价，然而竣工结算审计结果直接关系到施工单位和建设单位的切身利益，是核实工程项目造价的重要手段，也是防止我国国有资产流失的有效手段。因此做好竣工结算审计这项工作是至关重要的。　　文章首先阐述了在当前背景下做好竣工结算审计工作的重要意义，介绍了工程项目竣工结算审计相关理论知识，总结了国内工程项目竣工结算审计的现状，加强了对当前形势下我国工程项目竣工结算审计的相关问题的认识，加以案例阐述了目前国内工程项目中存在的主要问题，并通过博弈论建立施工单位和审计单位审计合谋博弈模型，予以分析。然后，结合自身实习的工作经验及文中提出的我国工程项目结算审计中存在的问题和风险，主要从工程项目竣工结算审计技术方法、政策条款两方面提出了合理的对策和建议，为将来国家制定或修订审计政策提供参考，希望能使未来的工程审计工作更加合理和规范，提高可操作性，有效节省资金，使投资利益最大化，减少建筑领域腐败现象的发生，提高审计质量。最后，探讨我国工程审计发展的趋势，介绍全过程跟踪审计，了解全过程跟踪审计的优势及其实施的必要性，强调其是在解决竣工结算审计存在问题的过程中不断发展完善的，提倡工程项目实行全过程跟踪审计。