中药现代化是当代中药发展中一个最热门的研究方向，已成为国内外医药界的一大热点。随着中药现代化、国际化的深入发展，中药指纹图谱分析技术应运而生。中药指纹图谱分析是一种从整体上研究和鉴别复杂中药物质体系的技术工具，由于它具有指纹特征分析、谱图整体分析、宏观推断分析等特点，适合于分析复杂化学物质组成的稳定性，故在当今中药乃至天然产物质量评价中起到重要的作用。 目前，相似度作为中药指纹图谱的一个参数，已被国家药典委员会确定为中药指纹图谱标准中的一项重要评价指标。在获取了中药样品指纹图谱后，如何计算并评定各批次产品指纹图谱间的整体相似程度，定量描述它们各自化学组成的差异性和波动情况极为重要，为此，迫切需要研究中药指纹图谱相似性测度并建立评价相似性测度的方法。 该文对中药色谱指纹图谱相似度分析进行了研究，并将其应用于田基黄色谱指纹图谱相似度的分析，主要的研究工作和成果包括以下几方面的内容： 1、研究与本课题有关的背景知识，包括中药指纹图谱的概念、分类、研究进展和国内外对指纹图谱的相关政策，色谱法的基本原理和分类，中药色谱指纹图谱构建原则以及构建色谱指纹图谱的基本步骤，常用的色谱法指纹图谱构建方法，从理论上为后继工作的展开打下了一定的基础。 2、总结了中药指纹图谱相似度算法研究中的需要解决的一些问题。研究了小波分析的多分辨率分析特性，并将它运用于色谱指纹图谱数据处理，通过实例分析反映了小波分析在中药色谱指纹图谱数据处理中良好的应用前景。 3、提出了一种基于模糊模式识别的对照指纹图谱建立方法。将模式识别方法中的传递闭包法应用于中药对照指纹图谱的建立过程中。通过对田基黄薄层色谱指纹图谱分析，得出田基黄薄层色谱指纹图谱的对照指纹图谱数据，实验结果表明该方法是可行的，而且在一定程度上提高了对照指纹图谱的合理性。 4、总结了中药指纹图谱相似度计算方法。在分析各相似度算法的基础上，提出了一种组合算法，该算法能根据具体需要组合相似度公式。通过举例，说明了组合算法在对小峰差异检测能力和图谱间谱峰比例关系差异检测能力方面体现出的优势。