蜂蚜蝇族两属线粒体全基因组序列及系统发育分析

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蜂蚜蝇族Volucellini隶属于管蚜蝇亚科Eristalinae,全世界已知4属,中国仅有2个属:蜂蚜蝇属Volucella Geoffroy,1762和缺伪蚜蝇属Graptomyza Wiedemann,1820,蜂蚜蝇属主要分布在古北区和东洋区,有少量种类在新北区和澳洲区也有分布,至今在新热带区和非洲区无分布记录,全世界记录约有51种,中国分布约23种;缺伪蚜蝇属全世界记录约83种,中国记载约19种,属于热带和亚热带昆虫,主要分布在东南亚、南亚、东亚和非洲、澳洲以及太平洋地区。线粒体基因组因其具有母系遗传,分子量小,基因重组罕见,进化速率较快和基因保守等特点被广泛在动物起源、演化和分类及系统进化和亲缘关系的研究方面应用。截至2022年1月,NCBI数据库仅公布了1条蜂蚜蝇族Volucellini昆虫完整的线粒体基因组序列。本文新测序16条蜂蚜蝇族昆虫的线粒体基因组序列,结合NCBI等数据库中已公布的蚜蝇科线粒体基因组全序列,构建4个数据集,使用最大似然法(ML)和贝叶斯法(BI)分别构建了ML系统进化树和BI系统进化树,比较分析蜂蚜蝇族线粒体基因组的基本结构特征,探讨蜂蚜蝇族和蚜蝇科的系统进化发育关系。主要研究结果如下:1.获得蜂蚜蝇族Volucellini 2属14种昆虫完整的线粒体基因组全序列和2个控制区不完整的蜂蚜蝇族昆虫线粒体基因组序列。2.在NCBI检索到的1条已发布全序列,结合本实验获得的16个蜂蚜蝇族Volucellini物种进行比较线粒体基因组分析发现:(1)本实验测得蜂蚜蝇族Volucellini昆虫线粒体基因组的16个物种线粒体均可形成闭合环状双链DNA分子,且都包含13个蛋白编码基因,22个t RNA基因,2个r RNA基因和非编码区。(2)蜂蚜蝇族Volucellini昆虫线粒体基因组长度在15,621 bp-16,575 bp之间,16个物种都有高的A+T含量,A+T含量的范围在78.3%-81.4%之间。(3)蜂蚜蝇族Volucellini物种基因排序与模式物种相同,没有发现基因重排。(4)13个蛋白编码基因(PCGs)的起始密码大多数为ATN和TTG,nad2和cox1基因在16个蜂蚜蝇族物种中起始密码子都为ATT;cox3,nad4和nad4l基因在16个蜂蚜蝇族物种中起始密码子都为ATG。在16个蜂蚜蝇族物种中终止密码子多为TAA,少数基因以TAG和不完整的T为终止密码子。(5)22个t RNA基因的二级结构均为典型的三叶草,除t RNA-Ser1缺少一个环。16S r RNA二级结构存在6个结构域(I、II、Ⅲ、IV、V和VI,区域Ⅲ缺失);12S r RNA的二级结构存在3个结构域(I、II和III)。3.基于74条蚜蝇科Syrphidae和3个外群线粒体基因组序列构建最大似然(ML)和贝叶斯(BI)系统发育树。蚜蝇亚科Syrphinae的单系性在8个系统发育树中都被支持,管蚜蝇亚科Eristalinae在大多数发育树中没有恢复为单系,仅在PCG12数据集构建的ML系统发育树恢复了管蚜蝇亚科的单系性。蜂蚜蝇族Volucellini的单系性得到了很好的支持,蜂蚜蝇属Volucella物种和缺伪蚜蝇属Graptomyza均为单系性。本研究很好的解决了蜂蚜蝇族两属的系统发育关系,结果支持了蜂蚜蝇族的单系性,蜂蚜蝇属和缺伪蚜蝇属的单系性。蜂蚜蝇族两属的系统发育关系为:((((Volucella liupanshanensis+V.nitobei)+V.bivitta)+(V.latifasciata+V.pellucens))+((V.rufimargina+V.plumatoides)+V.nigricans))+(((Graptomyza sp1.+G.sp2.)+(G.complete+G.brevirostris))+((G.flavonotata+G.obtuse)+G.longqishanica)))。
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