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目的:运用NGS方法检测外周血的ctDNA了解肺癌患者的癌基因图谱,并通过监测耐药前后ctDNA变化来指导临床的治疗,并进一步探索耐药机制。方法:1.病例收集收集2016年3月至2016年10月在福州三家医院就诊的不可手术的局部晚期或晚期肺癌患者69例。2.ctNDA检测采集外周血样本,进行血液分离,提取血浆游离DNA、构建DNA文库,进行DNA的测序捕获,捕获后的DNA文库送至深圳市海普洛斯生物科技有限公司进行测序。3.生物信息学分析提取碱基信息、数据质量控制、获取变异信息,分析;结果:1.59例肺鳞癌和腺癌患者一共检测出313个基因突变,平均每个患者检测出5.3个基因突变,大部分的突变均为错义突变。69例患者中突变率高的基因为:ATM、TRRAP、MTOR、TP53、TOP2A、BRAF、RET、TSC2、FCT3、CDKN2A,突变频率分别为35%、30%、30%、28%、22%、22%、20%、19%、17%、16%。49例腺癌中突变频率高的基因为:ATM、MTOR、TRRAP、BRAF、APC、TP53、TSC2、TOP2A、TYMP、XPC,突变频率分别为:34%、30%、28%、24%、24%、22%、22%、16%、16%、16%。10例肺鳞癌中突变频率高的基因为:XRCC1、TP53、RRM1、TOP2A、TRRAP、ERBB2、CDKN2A、BRAF、CYP2D6、BRCA1,突变频率分别为:40%、40%、40%、30%、30%、30%、30%、20%、20%、20%。常见的致癌基因及其突变频率为:BRAF(22%)、RET(20%)、ERBB2(16%)、PIK3CA(5%)、KRAS(4%);而常见的抑癌基因突变频率分别为:TP53(28%)、CDKN2A(16%)、PTEN(13%)。2.共有23位患者检出EGFR基因突变,其中:EGFR-19del 13例,EGFR-21L858r突变5例,EGFR:exon18:c.G2155T:p.G719C合并EGFR:exon20:c.G2303T:p.S768I突变1例,EGFR-19del+EGFR T790M突变3例,EGFR-21 L858r+EGFR T790M突变1例,另外还检出KRAS:exon2:c.G34T:p.G12C突变1例,PIK3CA:exon10:c.G1624A:p.E542K突变1例。与应用ARMS法与相比应用NGS法检测外周血ctDNA检测出NSCLC EGFR基因突变的敏感度为56.5%,特异度达70%,与tDNA结果的总体符合率为91%。3.截止2017-1,应用EGFR-TKI进行靶向治疗的16例患者,有9例可以评估PFS,其中:5例患者PFS>5月,2例PFS<2月,考虑具有P53、NOTCH1基因突变的患者,可能预测不良的疗效。结论:1)应用深圳海普洛斯公司的基因panel检测进行血浆ctDNA检测技术上可行;2)应用NGS及相关的生物信息学分析的方法,可以检测出与肺癌相关的基因突变位点;3)动态监测血浆ctDNA变化可以指导临床实践、探索耐药机制。