海路运输形式日渐成为危化品跨国家、跨地区运输的主体。危化品货物特殊理化属性以及海运过程中环境复杂性的影响,造成货物运输安全的不确定性增加。从复杂科学角度出发,海上危化品运输系统由“人-船舶-货物-环境-管理”五个子系统组成,且各子系统又由多种指标构成。在非线性作用下,各子系统、指标间的差异性产生系统负效应,从而对海上货物运输安全产生不利影响。针对海上危化品运输系统负效应的产生原因,从和谐理论角度出发研究系统和谐性,提高运输过程中的安全性。为解决海上危化品运输系统组织成分差异性对系统功能的影响,研究了危化品“货物的协同性”和“人的和谐性”,并基于此提出危化品运输系统的涌现机理、协同演化机理,进而绘制系统协同演化机理图；研究运输系统在协同相干过程中的和谐性,并提出海上危化品运输系统的和谐机理,进而绘制运输系统的和谐机理图。从和谐理论出发,将系统和谐性分为构成和谐、组织和谐、内环境和谐与外环境和谐,并基于此构建海上危化品运输系统和谐性测度模型；为更加准确地展现系统和谐状态的演化过程,提出和谐四边形法则并获得海上危化品运输系统的和谐性判据；结合海上危化品运输系统特点,建立海上危化品运输系统的和谐评价指标体系,并通过构建和谐指标隶属函数获得单指标系统和谐值；为获得一定时空下系统整体和谐度值,建立系统和谐矩阵；对不同时空下系统和谐值进行MATLAB仿真,获得海上危化品运输系统和谐状态图像,并证明了系统和谐状态与系统的安全状态紧密相关。从复杂系统整体性出发,以协同理论、非线性理论与和谐理论为基础开展海上危化品运输系统和谐研究,是对以往海上危化品运输系统安全研究的有益补充,完善了海上危化品运输安全研究的内容。