miR-125b在C3H10T1/2间充质干细胞成骨分化过程中的表达及其靶基因分析

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研究背景及目的:微小RNA(microRNA、miRNA、miR)是一类长约21-25nt的单链小分子RNA(single-stranded RNA,ssRNA),位于细胞染色体的非编码区,是一组不编码蛋白质的短序列RNA,即非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),通过调节体内代谢过程而发挥其生物学作用。 miRNA通过与其靶mRNA分子的3’端非翻译区(3’-untranslational region,3’ UTR)互补配对,抑制靶mRNA的翻译或降解靶mRNA,从而负性调控靶基因表达。近年来,越来越多的证据表明,miRNA通过下调维持干细胞未分化状态的某些基因,同时激活干细胞谱系特异性基因,调节干细胞的定向分化,如成骨分化、成脂分化等。成骨细胞是骨形成中的一类重要细胞,源于间充质干细胞(mesenchymal stemcells,MSCs)。在MSCs向成骨细胞分化过程中存在多水平的调控机制,多种激素及旁分泌和/或自分泌细胞因子被证实参与这一调节。有文献报道提示miR-125b可能是骨髓MSCs向成骨细胞分化过程中的一个重要调节因子,但具体调节机制还有待进一步探索。因此,本研究旨在探明miR-125b在MSC成骨分化过程中的表达变化,明确其靶基因,初步探讨miR-125b调节MSCs成骨分化的可能机制。方法:1.以miR-125b为研究对象,利用基因芯片检测小鼠间充质干细胞C3H10T1/2成骨分化过程中miRNA表达谱,以未分化细胞为对照组,诱导成骨分化7天(第一组)、14天(第二组)为实验组,分析三组之间miRNA尤其是miR-125b表达差异。另外,利用实时定量RT-PCR检测成骨分化1、3、5天后miR-125b表达结果。2.为明确miR-125b作用靶点,我们通过picTar、miRanda、Targetscan三个数据库进行生物信息学分析,查找miR-125b的潜在靶基因,在miR-125b的众多预测靶基因中,挑选具有成骨调节作用的核心结合因子Cbfβ进行实验验证。3.为了验证Cbfβ3’-UTR是miR-125b作用的真正靶点,我们将预测的Cbfβ3’-UTR靶位点上下游片段进行克隆、突变后,插入PmiR-report荧光素酶表达载体中,以pRL-TK为内参照载体。为了获得足够的最终实验结果信息,根据Cbfβ3’UTR预测结合位点序列合成了:①miR-125b完全互补序列(Perfect Target,PT),②野生型结合位点序列(microRNA recognition element,MRE),③去掉种子结合区的突变形式结合序列(MRE-mutation,mut)。为增加效能,分别使用2×PT,2×MRE,2×mut,前期文献已证实了这种质粒构建方式的适用性。然后将重组质粒、对照质粒miR-125b mimic或anti-miR-125b共转染293T细胞,48小时后裂解细胞行双荧光素酶报告基因检测。4.在C3H10T1/2细胞中过表达外源性miR-125b和干扰表达内源性miR-125b,48小时后行Western-Blot和RT-PCR检测Cbfβ表达量变化,观察miR-125b对Cbfβ的调控作用。研究结果:1.生物芯片结果显示:①C3H10T1/2细胞诱导分化7天组与未分化组对比:表达量上调分子12个,下调分子30个;分化14天组与分化7天组对比,表达上调miRNA分子92个,下调miRNA分子94个;分化14天组与未分化组对比:表达量上调分子84个,下调分子98个(上调以2倍为下限,下调以0.5倍为上限)。②C3H10T1/2细胞诱导分化7天组和14天组miR-125b表达量与未分化组表达量比值分别为:未分化组/分化7天组/分化14天组=1/0.8710/0.6378.。实时定量RT-PCR检测结果示:C3H10T1/2细胞成骨诱导分化1、3、5天后miR-125b表达量较未分化组明显降低(P<0.05)。2.生物信息学分析结果表明,小鼠种系miR-125b作用靶点共计342个,其中包括在骨形成过程中具有重要作用的核心结合因子Cbfβ,Cbfβ mRNA的3’-UTR含有一个与miR-125b种子序列匹配的潜在结合位点。3.重组质粒pMIR-2×PT,pMIR-2×MRE,pMIR-2×mut经HindⅢ单酶切,琼脂糖凝胶电泳,可于5000-7500bp之间获得目的条带。送大连TAKARA公司测序,结果示碱基序列和设计序列完全一致,重组质粒构建成功。双荧光素酶报告基因检测结果:将PmiR-2×PT与miR-125b mimic或anti-miR-125b共转染293T细胞后,荧光素酶活性有显著减少或增加,证实了双荧光素酶报告基因实验体系的有效性。将PmiR-2×MRE与miR-125b mimic共转染细胞后,荧光素酶表达受到明显抑制,而转染PmiR-2×mut与miR-125b mimic后,荧光素酶表达无明显变化。另外,我们发现将anti-miR-125b与PmiR-2×MRE、miR-125b mimic共转染后,可中和掉miR-125b mimic对PmiR-2×MRE的抑制作用;将anti-miR-125b与PmiR-2×mut、miR-125b mimic共转染后,荧光素酶活性仍无明显变化。实验重复3次,结果有统计学意义(P<0.05)。4. Western-Blot和RT-PCR结果显示:在C3H10T1/2细胞中过表达miR-125b,Cbfβ蛋白和mRNA表达量明显降低;用转染anti-miR-125b的方式抑制miR-125b后,Cbfβ蛋白和mRNA表达量明显升高。结论:miR-125b在小鼠间充质干细胞C3H10T1/2成骨分化后表达量降低。Cbfβ是miR-125b的一个靶基因,在C3H10T1/2细胞中,miR-125b可负性调节Cbfβ表达。
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