随着世界科技、经济的快速发展，高新技术及其产业已成为国际竞争的核心，经济发展的支柱，国家综合国力的标志。自1951年美国斯坦福研究园建立并发展为“硅谷”以后，许多国家和地区纷纷效仿美国，在条件适宜、智力密集的地区开辟高新区，从而发展本国、本地区的高技术及其产业。我国国家高新区是在世界新技术革命风起云涌，各国不断加快高技术发展步伐，国内深化改革，扩大开放，大力发展科学技术的背景下创建和发展起来的。经过10几年的发展，我国国家高新区的整体布局基本完成，并已开始进入以技术创新为核心的“二次创业”发展阶段。创新是国家高新区存在与发展的灵魂。我国著名经济学家吴敬琏先生曾经提出过“制度重于技术”。体制创新是加快技术创新的前提与保证。面对中国已加入WTO的新形势，高新区只有加快体制改革，率先建立起科学、高效的管理体制，才能在国家经济发展中立于不败之地。本文抓住当前国家高新区“二次创业”亟待解决的高新区行政管理体制创新问题，围绕如何创新国家高新区的管理体制展开论述。文章首先对国内外有关高新区发展的相关理论进行了解析，为创新国家高新区管理体制提供可借鉴的理论依据；然后运用比较分析、实证分析方法对中外高新区管理模式与体制特征进行论述，分析了我国国家高新区管理体制中尚存在的一些制约高新区进一步发展的问题，并提出了解决这些问题的具体构想。