基于双碳理论和可持续发展理念的碳排放效率的提高对推进长江经济带高质量发展具有重要意义,评估农业碳排放及其效率的时空演变特征及驱动机制,可为长江经济带实施碳智慧农业,达成双碳目标提供重要支撑。基于长江经济带2000-2019年105个市域尺度的面板数据,运用方向距离函数（DDF）及截断随机Tobit回归模型,分析长江经济带碳排放量及其效率与影响因素,运用探索性空间数据分析以及泰尔指数系统研究了 2000～2019年长江经济带及不同带段尺度的碳排放效率的时空演化格局、地区差异及其形成机理。结果表明:（1）从来源来看,长江经济带农地利用碳排放量大于能源消耗碳排放量。从农地利用维度测算,2002年碳排放量是2.03×107万t,占总排放量的86.38%,2018年排放量是3.34×107万t,占总排放量的85.66%;从能源消耗维度测算,2001年碳排放量是3.08×106万t,占总排放量的12.19%,2009年排放量是7.88×106万t,占总排放量的23.16%;2002年总排放量最小,为2.35×107万t,2018年总排放量最大,达到3.74×107 万 t。（2）基于共同前沿和分组前沿DDF模型分析,研究期内长江经济带及各段农业碳排放平均效率存在区域差异,共同前沿下大部分效率均值低于0.8,分组前沿下大部分效率均值低于0.9,研究期内未达到有效状态,效率值呈现波动上升趋势。长江经济带上段在不同前沿条件下,均呈现出前期效率低下,后期提高并保持比较稳定状态。长江经济带中段在两种前沿条件下,均长期处于低效状态。长江经济带下段在两种不同前沿条件下,存在一定的差异。分组前沿条件下明显高于共同前沿下,且在两种前沿条件下均高于其余区域。两种前沿条件下,2019年农业碳排放效率值均有所下降。长江经济带中段共同技术均值整体上最接近1,实际效率值和潜在的效率值差距较小。（3）从时间趋势来看,2000-2019年长江经济带农业碳排放效率,整个长江经济带效率2006年最低,2019年效率最高,上、中、下三个带段农业碳排放效率波动趋势相同,效率收敛性较强;从不同带段农业碳排放效率来看,长江经济带上、中段农业碳排放效率较低,其值比较接近,下段平均农业碳排放效率高于中、上段。从市域尺度来看,2000-2019整个时段,上海市的农业碳排放平均效率最大,平均值为0.94,除了贵州的六盘水市外,排名前15位的城市主要分布在江苏省和浙江省;湖北十堰市农业碳排放效率最低,2000-2019年平均值为0.15,排名后15位的城市主要分布中段的湖北、湖南、江西以及上段的四川,平均得分小于0.33。长江经济带农业碳排放效率区域内整体差异较大,中上段区域内差异显著,下段地区差异较小。（4）长江经济带农业碳排放效率影响因素存在显著的空间尺度效应。从相同影响因素不同尺度下的影响性质分析,农民人均消费支出、种植业结构、城镇化率和研发投入对区域农业碳排放效率产生正向影响。从同一尺度不同影响因素的作用程度、作用的性质分析分析,长江经济带中段和下段,同一带段内不同因子对农业碳排放效率影响差异性明显,上段不同影响因素作用方向相同,从因子作用程度分析,城市化水平对长江经济带以及各段的农业碳排放效率影响较大,表明长江经济带城市化水平的提高对农业减碳目标的实现作用显著。从共同前沿和分组前沿不同视角,采用非期望DDF模型,评价长江经济带及上段、中段和下段的农业碳排放效率,在考虑农业碳排放效率的区域差异和决策单元的异质性条件下,通过Tobit回归模型识别农业碳排放的驱动机制。研究成果不仅可以为长江经济带实施低碳农业实践提供指导,而且丰富了区域农业碳排放效率评价理论方法,可为其它产业碳排放效率评价提供方法借鉴。