应用扫描电镜技术对黑三棱科和香蒲科的代表植物及相关类群的微形态学和花器官发生进行了研究。结果表明： 1.黑三棱科和香蒲科及相关类群植物叶表皮的微形态特征存在着一定差异，这些差异主要表现在气孔类型、气孔器附属物及表皮细胞垂周壁式样上。其花粉微形态特征也有一定的区别，主要表现在花粉形态、花粉长轴大小、萌发孔类型及花粉外壁纹饰等方面。这些特征作为分类学证据具有重要价值。黑三棱科和香蒲科及相关类群植物的叶表皮及花粉微形态特征研究，在很大程度上丰富了上述类群的系统学资料，这些资料对探讨黑三棱科和香蒲科的分类地位及其系统关系等均具有重要意义。 2.曲轴黑三棱的花器官发生方式是：雄花花被片原基几乎同时发生，3—5枚不等，之后，雄蕊原基亦同时发生，通常2—5枚；雌花花被片原基轮状发生，后期发生分裂，花被片数目多为4或5枚。水烛的花器官发生方式与曲轴黑三棱的基本一致，但水烛的雌花花被片更为特化，在发育的后期特化呈丝状。石菖蒲的花被片原基6枚，分两轮发生，位于外轮的1枚远轴花被片原基最先发生，明显大于其它花被片，外轮的另2枚花被片原基在近轴位置相继发生，内轮花被片原基的发生顺序与外轮花被片的发生顺序相反；雄蕊原基6枚，分两轮发生，其发生方式与花被片的相似；3个心皮原基同时轮状发生。三种代表性植物的花器官发生研究，不仅丰富了上述类群的系统学资料，而且使我们观察到其花部的早期发生和发育过程，大大加深了对植物花部结构复杂性和多样性的认识，这对探讨黑三棱科和香蒲科及相关类群的系统学关系等具有重要意义。 3.综合黑三棱属与香蒲属的形态学、叶片微形态学、孢粉学，特别是花器官发生特征，作者支持并重新提出将黑三棱属置于香蒲科中（即广义香蒲科概念），不支持黑三棱科成为独立的科。根据黑三棱属与香蒲属花器官发生过程中花被片的特化程度，认为在系统发育上，香蒲属比黑三棱属具有较高的系统演化地位，香蒲属是香蒲科中较为进化的类群。 4.广义香蒲科与菖蒲属的花器官发生特征差别明显，它们之间的亲缘关系较远；菖蒲属具有一些较广义香蒲科更为原始的特征，表明其具有较低的系统演化地位。广义香蒲科与露兜树科有一定亲缘关系，而与雨久花科的亲缘关系则较远。