本研究以内蒙古绒山羊150只个体为材料,利用DNA测序和序列分析、生物信息学分析、SSCP技术,克隆和分析绒山羊K5基因启动子区,并研究了K5基因启动子的多态性。通过生物统计学软件的应用,对一些绒毛性状指标进行了统计分析,这些指标包括产绒量、毛长、毛细度、绒长、绒细度和绒厚度。对检测的3个SNP位点进行了频率、平衡性、遗传多态性及其绒毛性状的相关性进行统计分析。试验一：参考牛K5启动子序列设计6对引物克隆绒山羊K5启动子区4671bp,并以20只绒山羊的混合DNA作为模板进行PCR扩增,PCR产物回收纯化后进行双向测序发现有三个多态位点,分别位于ATG-697bp,-2576bp和-2770bp处。分析绒山羊K5基因启动子的结构,发现绒山羊K5基因启动子ATG—101bp位置是转录起始位点；两个TATA盒分别位于ATG-129—124bp和-178--174bp位置；通过在线软件预测发现(按5’→3’)有24种转录因子结合位点。其中,转录因子Lyf-1和CDP CR是绒山羊特有的；转录因子HNF-4,AML-la,HSF2,AP-4,AP2,SP1,Nkx-2和GATA-1在绒山羊、牛和人K5启动子上的结合位点高度保守。另外,绒山羊和牛两个最小增强子的位点在相同位置,分别位于ATG-138-89bp和-11465bp位置,含有26bp重叠区。发现突变位点后再一次进行序列分析发现在ATG-697bp处G→A突变后预测出转录因子HSF2结合位点,-2576bp处C→A突变导致GATA-3转录因子结合位点的出现,—2770bp处突变没有预测出任何转录因子结合位点。试验二：以150只内蒙古绒山羊为研究对象,对K5基因启动子采用SSCP方法进行多态型检测。结果表明：(1)K5启动子P1引物(-697bp处)没有出现多态。P2引物扩增片段中存在—2509(G/A)和—2576(C/A)2个SNP位点,表现为AA、BB、CC、AB、AC、BC和CD7种基因型,其基因型频率分别为49.3%、1.3%、5.3%、19.3%、15.3%、7.3%和1.3%。经x2检验后,该等位基因频率不处于哈迪温伯格平衡(P<0.05),多态信息含量(PIC)为0.5039,属与高度多态(PIC>0.5)。(2)1个SNP多态位点在P3引物扩增片断中,位置在在ATG上游—2770(G/A),表现为AA、AG、和GG3种基因型,其基因型频率大小为：AA>AG>GG。经x2检验后,内蒙古绒山羊群体在该位点未达到哈迪温伯格平衡态(P<0.05),多态信息含量(PIC)为0.3333,属与中度多态(0.25<PIC<0.5)。关联分析表明：(1)P2引物之间的多态位点的AB、BC和CD型个体的绒长显著高于AA、BB、CC和AC型个体(P<0.05)；7种基因型对产绒量、毛长、毛细、绒细和绒厚均没有显著影响(P>0.05)。(2)P3引物之间的3种基因型(从、AG和GG)多态性,对绒毛性状都没有显著的影响(P>0.05)。因此K5基因启动子—2509(G/A)和—2576(C/A)2个SNP位点可能作为绒长选择的DNA标记。