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本研究在全面分析国内红树林生态恢复的形势的基础上，针对厦门红树林生态恢复过程中存在的具体困难，从潮位、底质、有害生物等角度具体分析了厦门红树林生态恢复面临的困难。抓住影响红树植物苗木成活的关键因素：滩涂潮位太低，从成活率、生长、光合、营养积累、次生代谢物质等探讨了滩涂高程与红树植物苗木生长之间的关系；比较了不同种植模式(树种搭配、种植密度)等的生态恢复效果；探讨了红树林生态恢复过程中生态功能的变化。
1．研究了滩涂高程对红树林生态恢复的影响研究，从理论上和实践上明确了滩涂高程是决定红树林造林成败的关键。在翔安样地滩涂设置7个高程样带，研究了不同高程对厦门主要红树林造林乡土种秋茄的影响。秋茄林的成活率、高度、冠幅和郁蔽度，以及林木年净生物量都与高程有显著关系。明确提出了厦门翔安红树林宜林滩涂高程。结果表明：秋茄的宜林滩涂高程要在黄海高程1.0 m以上。
2．随着高程的增加，秋茄幼苗的光合电子传递速率、最大光合效率潜能(Fv/Fm)呈现出升高的趋势，非光化学淬灭系数表示(NPQ)逐渐下降。当高程低于0.6 m时，秋茄幼苗的光合效率低下，光破坏严重，淹水严重影响了秋茄幼苗的光合作用。当高程高于0.6 m时秋茄幼苗的光合活性没有受到太大影响，光合作用能正常进行。
3．测定不同滩涂高程下1年生秋茄幼苗叶片单宁、C、N、叶绿素含量，研究了水淹胁迫对秋茄幼苗次生代谢物质单宁的影响及作用机理。结果表明，随着滩面高程的降低，光合能力下降，同化作用受到抑制，C/N及单宁含量降低，秋茄幼苗叶片中C、N含量及单宁含量对淹水胁迫的响应符合碳素/营养平衡假说。
4．比较了不同种植模式和搭配种植的生态恢复效果。首先通过红树林的密植控制滩涂后，对1年生的秋茄幼苗进行疏伐，设置4种密度：(1)20 cm×20 cm；(2)30 cm×30 cm；(3)50 cm×50 cm；(4)100 cm×100 cm，以及三种搭配种植：(1)秋茄纯林；(2)无瓣海桑纯林；(3)秋茄、无瓣海桑及红海榄混种林。实验结果表明：疏伐密度50 cm×50 cm，秋茄生长最好，有利于迅速地改造为乔木群落，而秋茄、无瓣海桑及红海榄混种林生长最好，有助于提高幼苗成活率及恢复效果。
5．研究了在既定区域的红树林生态恢复过程中，生物因子藤壶的附着对秋茄幼苗正常生长的影响，并对比研究了不同红树林区域内藤壶对人工红树幼苗的危害情况，揭示了藤壶在红树林区的附着和分布在数量上与样地高程、海水盐度及潮水速度的密切关系。研究结果表明浸淹深度大、海水盐度高、水流通畅的滩涂上藤壶危害严重，红树林幼苗倒伏率或死亡率明显增加。