我国从90年代末，高等教育实行了大规模的扩招政策，高等教育开始由精英化教育转向了大众化教育，导致了我国高等教育资源的需求越来越高，加剧了高等教育经费总量短缺和高效规模不断扩大之间的矛盾，近年来，我国高校经费逐渐向多元化筹资模式转变，政府拨款仍旧是高校最主要的经济来源。进一步改进和完善高等教育拨款制度，提高拨款使用效率，合理有效的财政拨款制度对促进高等教育发展具有深远意义。“基数+发展”模式和“综合定额+专项补贴”模式都在相应的阶段发挥了其重要的作用。随着我国高等教育体制改革的深化，对拨款机制也提出了相应的要求。本文首先回顾了我国高等教育财政拨款的历史，分析了我国财政拨款制度的现状，目前我国高等教育财政拨款总体不足，财政经费的管理一直处于事权和财权分离，导致高等教育拨款脱节。财政制度不够透明，高校资源利用率不高等问题同时存在。接着着重分析了美国、英国、日本三国的拨款制度，进行比较研究，吸取国外的经验教训，为我国财政拨款制度改革提供经验。最后从人力资本理论和公共产品理论入手，结合甘肃省属高校目前的情况，在考虑传统的“生均综合定额+专项补贴”的拨款方式上，提出了考虑学科、绩效等多因素的“学科生均综合定额+专项补贴”的拨款公式，建立和完善高校财政预算拨款体系。之后针对甘肃省属本科院校的拨款体制提出了八点建议：一、建立权威的中介拨款机构，二、政府对省属高校实行绩效拨款制度，三、建立分学科评估体系，四、建立成本核算中心、完善学生资助体系，五、加大高等教育财政投入，完善多元化投入机制，六、提高产学结合，增加科研创收，七、强化法律约束效力，八、加大民族院校（专业）教育的扶持力度。