随着我国高等教育的改革,合并大学已成为我国高等教育事业的重要组成部分。截止2011年上半年,全国已有1111所高等学校经合并调整为454所,在高等教育发展的历史上都是十分罕见的。目前,如何评价合并大学的成效,如何进一步促进合并大学的融合与发展,已成为我国高等教育重要的关注领域。因此,本文选择中部地区13所合并大学相关数据对大学合并后的科研发展水平进行研究具有重要的理论和实践意义。本研究先通过文献回顾,在利益相关者、教育投入产出等理论进行综述的基础上,对合并大学科研发展水平进行分析,然后具体分析我国中部地区合并大学的科研发展水平的现状,研究发现：合并大学科研发展中存在的问题都归结于科研资源是否得到优化、重组。针对这一问题,本研究最终确立了影响合并大学科研发展水平的主要指标,并对指标数据的收集与整理得出结论。对我国中部地区13所合并大学的科研发展水平运用SPSS16.0统计软件对数据进行因子分析与聚类分析,研究认为：虽然中部地区合并大学的科研发展水平整体不高,但呈现出越来越好的发展趋势；中部地区合并大学科研发展水平发展不平衡,排名最前与最后的两所合并大学的综合得分相差很远；中部地区大学合并后的科研发展成效表现为一定的延时性,即合并前后呈现先降后升的状态,这体现了中部地区合并大学学术资源优化重组的意义；影响中部地区合并大学科研发展水平程度的主要因子顺序为：科研产出因子、科研投入因子和科研服务因子；华中科技大学是中部地区合并大学中科研发展水平最好的大学。