lncRNA AABR07005593.1在PM2.5诱导呼吸系统炎症中的作用机制

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:haier__
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:本研究旨在探索长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)与广州地区采集的细颗粒物(Fine particulate matter,PM2.5)诱发大鼠肺泡巨噬细胞(NR8383)和SD大鼠的炎症反应间调控关系。方法:第一部分:采集广州地区的PM2.5暴露于NR8383细胞诱发炎症建立炎症模型。用CCK8法检测不同染毒时间、染毒浓度下的细胞存活率。细胞因子抗体芯片筛选出主要的炎性因子,RT-q PCR、ELISA进行验证。通过lncRNA高通量测序筛选与RT-q PCR验证出差异显著的lncRNAs。通过胞浆胞核亚细胞定位实验确定lncRNAs在细胞中的分布情况并确定lncRNA AABR07005593.1作为研究的目的lncRNA。使用RNAi技术构建细胞转染lncRNA AABR07005593.1的loss-of-function体系,转染联合PM2.5暴露染毒,观察炎性因子的表达水平。通过lncRNA高通量测序、目的lncRNA功能实验及KEGG数据库分析,我们预测目的lncRNA能通过调控NF-KB信号通路发挥炎性作用,故用NF-ΚB特异性抑制剂(BAY11-7082)预处理细胞,观察lncRNAAABR07005593.1、IL-6的表达水平。而后通过CHIRP-MS实验拉下与目的lncRNA特异性结合的蛋白,并通过质谱验证特异性结合的蛋白。第二部分:研究通过采集广州地区的PM2.5暴露于SD大鼠建立炎症模型。PM2.5染毒后定期称量SD大鼠体质量,观察其活动情况。实验结束后,收取大鼠全血进行血常规检测;解剖、分离肺组织计算肺部脏器系数和病理学检查。使用肺组织进行细胞因子抗体芯片筛选出差异的炎性因子,通RT-q PCR验证炎性因子与染毒剂量之间的时间-剂量反应关系;并通过RT-q PCR验证体外实验筛选出的lncRNAAABR07005593.1在大鼠体内的表达情况。结果:第一部分(1)PM2.5对细胞存活率的影响NR8383细胞暴露于PM2.5染毒液后发现,随着染毒剂量和/或染毒时间的增加,NR8383细胞的存活率不断降低,差异具有统计学意义(P﹤0.05)。(2)PM2.5诱导NR8383细胞产生炎症据细胞因子抗体芯片实验结果筛选出IL-6、IL-1α、TNF-α作为炎症的观察指标。RT-q PCR和ELISA验证发现:IL-6、IL-1α、TNF-α与染毒浓度呈剂量-反应关系。(P﹤0.05)。(3)lncRNA筛选及验证实验通过lncRNA高通量测序,筛选出10个表达丰度高、差异明显且与炎症相关的lncRNA。使用RT-q PCR验证差异lncRNAs,最终筛选出6个有差异的lncRNA。(4)胞浆胞核亚细胞定位实验对筛选出的lncRNA进行胞浆胞核亚细胞定位实验,发现lncRNAs大部分分布于胞核,少部分分布于胞浆中。其中lncRNA AABR07005593.1胞浆胞核分布比例较均匀,胞浆:胞核=45%:55%,故选择lncRNA AABR07005593.1作为后续研究的目的lncRNA。(5)lncRNA AABR07005593.1功能实验通过构建细胞转染体系,发现si RNA-4片段沉默效率最高(约70%),故选择其作为转染的有效片段。通过转染联合PM2.5暴露,发现lncRNA AABR07005593.1在转录水平、蛋白水平上均能调控IL-6的表达水平,差别具有统计学意义(P﹤0.05)。(6)NF-ΚB阻断实验使用NF-ΚB特异性阻断剂(BAY11-7082)预处理细胞1个小时后,发现相比于PM2.5组,lncRNA AABR07005593.1、IL-6表达水平下降,差异具有统计学意义(P﹤0.05)。(7)CHIRP-MS实验AABR07005593-probe具有特异性,能够大量富集到目的RNA而不会富集其他基因。通过银染结果可知,目的lncRNA AABR07005593.1结合的蛋白主要显著分布在75KDa附近。质谱结果表明MCCC1(75KDa)是最明显的差异蛋白,故认为目的lncRNA AABR07005593.1能与MCCC1结合,研究表明双链RNA与MCCC1和MAVS互相作用,三者形成一个复合体,该复合体诱导IKK与IKB的活化,进而激活NF-ΚB通路,最终促进了IL-6、IL-8、TNF-α的表达。故认为在本次研究中lncRNA AABR07005593.1-MCCC1-MAVS三者形成一个复合体,进而诱导下游的NF-ΚB激活,从而调控IL-6的表达水平。第二部分:(1)体质量:染毒第1天,雌性中剂量、雄性高剂量组大鼠体质量有稍微下降,但差异没有统计学差异(P≥0.05)。与第0天、第1天相比,染毒第7天、第14天各剂量组大鼠的体重均恢复增长的趋势,差异有统计学意义(P﹤0.05)。(2)血常规:染毒1天、7天雄性高剂量组大鼠的WBC计数相比于对照组增高,差异具有统计学差异(P﹤0.05),雌性低剂量组、雄性高剂量组LY相比于对照组增高,差异具有统计学意义(P﹤0.05)。(4)脏器系数:染毒1天后,大鼠肺脏仅在性别主效应上有统计学意义,雌性大鼠的脏器系数高于雄性大鼠(P<0.05)。染毒7天、14天肺脏脏器系数与性别、组别均无统计学差异(P≥0.05)。(5)肺组织病理检查:低剂量染毒组大鼠出现轻度气管周、血管周炎症细胞浸润,轻微肺泡腔内巨噬细胞增多。中剂量染毒组中出现轻微支气管腔内可见黑褐色颗粒,肺泡内可见少量出血及较大量中性粒细胞与巨噬细胞,肺泡上皮轻度增生;第1天、第7天高剂量染毒组细支气管、肺泡管、肺泡囊、肺泡可见黑褐色颗粒,肺泡内可见巨噬细胞增多,部分巨噬细胞吞噬黑褐色颗粒,部分区域肺泡塌陷,血管周轻微炎症细胞浸润。中剂量、高剂量染毒14天可见大鼠肺泡壁破裂,肺泡融合,肺气肿形成。(6)大鼠肺组织炎性芯片及RT-q PCR结果:IL-6的表达水平随染毒剂量的增加而增加,差异有统计学意义(P﹤0.05)。(7)lncRNA AABR07005593.1表达验证:除染毒7天雄性大鼠外,lncRNA AABR07005593.1随染毒剂量的增加呈增加的趋势,差异有统计学意义(P﹤0.05)。结论:1、PM2.5暴露降低NR8383细胞存活率,诱发NR8383细胞产生炎症反应。2、lncRNA AABR07005593.1在PM2.5致NR8383细胞炎症发生发展过程中发挥促炎作用。3、lncRNA AABR07005593.1与MCCC1、MAVS形成复合体,调控NF-ΚB通路,引起下游炎性因子IL-6表达水平升高,发挥其促炎作用。4、PM2.5可引起SD大鼠炎症反应。5、大鼠肺组织中lncRNA AABR07005593.1与PM2.5染毒剂量、炎性因子表达水平呈正相关,其在PM2.5诱发呼吸系统炎症中发挥促炎作用。
其他文献
目的:探讨急性缺血性脑卒中后血管性认知障碍非痴呆型(vascular cognitive impairment no dementia,VCIND)患者事件相关电位P300特点。方法:选取2017年8月-2018年7月入住广西壮族自治区人民医院神经内科,发病时间在1周内,符合入选及排除标准的首次发生急性脑卒中的患者共62例,按其认知功能水平分组,其中VCIND组32例,智能正常组30例,对所有患者
目的:在急性胰腺炎的发病机制中,胰腺导管上皮屏障的损伤发挥着重要的作用,而核因子κB(Nuclear Factor-kappa B,NF-κB)信号通路的活性与胰腺导管上皮屏障的破坏密切相关,因此本研究的目的为探讨NF-κB信号通路在胰腺导管上皮屏障损伤中的作用。方法:采用人胰腺导管腺癌细胞HPAF-Ⅱ作为细胞模型,分别使用TNF-α和PDTC对细胞进行干预,细胞被分为control组、TNF-α
目的:旨在通过比较病情为轻型和重型的两组吉兰-巴雷综合征(Guillain-Barrésyndrome,GBS)患者的一般资料、临床特点、生化指标和肌电图特点,总结影响病情轻重程度的相关因素,并比较轻型和重型两组患者的治疗效果。研究方法:回顾性纳入广西医科大学第一附属医院神经内科于2015年1月至2019年12月收治并确诊为GBS的患者共94例,并在患者病情高峰时,根据Hughes评分标准将病情程
目的:探讨胸腔镜下不同平面的胸交感神经链切断术治疗原发性手汗症的远期疗效及并发症,寻求治疗原发性手汗症的最佳术式。方法:选取广西医科大学第一附属医院2012年8月至2019年12月接受胸腔镜下胸交感神经链切断术的162例原发性手汗症患者进行术后随访。根据胸交感神经链切断的平面不同,以切断的交感神经链最高平面为标准,分为3组:T2组(T2、T2+T3、T2+T3+T4胸交感神经链切断术)33例;T3
目的:分析复发型视神经脊髓炎谱系疾病(Neuromyelitis optica spectrum disease,NMOSD)患者急性发作期间各项血脂水平,探讨其与临床特点的关系。方法:回顾性收集234例2016年1月至2019年3月在广西医科大学第一、第二附属医院神经内科住院确诊为复发型NMOSD患者的一般资料、血清及脑脊液生化资料等,按照入院前30天内是否使用小剂量激素维持治疗(醋酸泼尼松0,
目的:近年来晚期肺鳞状细胞癌主要通过化疗治疗,治疗效果差,免疫治疗的出现给患者带来了新的希望。我们通过报道程序性死亡受体1(programmed death-1,PD-1)抑制剂治疗晚期肺鳞状细胞癌3例和文献复习,让临床医师对于肺鳞状细胞癌免疫治疗有进一步认识。方法:收集3例广西医科大学第一附属医院呼吸与危重症学科使用PD-1抑制剂治疗晚期肺鳞状细胞癌患者的临床资料。以“肺鳞状细胞癌”、“肺鳞癌”
目的:了解不同年龄的特发性膜性肾病(Idiopathic membranous nephropathy,IMN)患者的临床病理特点,为临床治疗提供数据。方法:采用回顾性分析2015年1月-2019年1月在广西医科大学第一附属医院就诊,诊断IMN随访12个月的患者242人。将患者根据年龄分为老年组(>60岁)62例和青中年(18-60岁)180例,分别收集患者临床资料、实验室检查和肾脏病理结果,对两
目的:评估含卡铂联合方案一线治疗不同分子分型晚期乳腺癌的疗效和安全性,并对影响近期疗效和患者预后的因素进行分析。方法:回顾性分析2013年12月至2019年9月期间,广西医科大学附属肿瘤医院收治的转移性乳腺癌患者177例,所有患者均接受了含卡铂联合方案作为一线解救治疗。卡铂的剂量和使用方法为AUC=5或400mg/m~2,静脉滴注,d1;联合使用的化疗药物包括紫杉类、培美曲塞、吉西他滨、长春瑞滨或
目的:比较第8版UICC/AJCC淋巴结分期系统(pN)与淋巴结转移率(MLR)、阳性淋巴结对数比(LODDS)和阴性淋巴结数(NLNs)分期系统在T4a期胃癌患者术后的预后分期预测效果,为制定理想的胃癌预后淋巴结分期系统提供依据。方法:回顾性分析广西医科大学第一附属医院胃肠腺体外科于2012年6月至2015年1月接受胃癌根治术的T4a期胃癌患者,并收集完整的临床病理及随访数据资料。首先,通过Sp
第一部分红霉素对烟草烟雾刺激下人巨噬细胞SIRT1的抗氧化应激作用目的:观察红霉素对烟草烟雾刺激下对人巨噬细胞SIRT1参与的氧化应激的调节,探讨红霉素的抗氧化应激机制。方法:选取人组织细胞淋巴瘤细胞(U937细胞)进行培养,在终浓度为200ng/ml的佛波酯(PMA)预孵育后将其诱导成人巨噬细胞,以诱导后的巨噬细胞为实验对象。将巨噬细胞分组处理:对照组、CSE组、CSE+红霉素(EM)组、CSE