胃癌相关miRNA的初步鉴定及丝裂霉素对胃癌细胞miRNA表达谱的影响

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目的本研究通过鉴定与不同分化程度人胃癌细胞株密切相关的miRNA,探讨了胃癌可能的发病机制;并初步分析丝裂霉素(MMC)对胃癌细胞miRNA表达谱的影响,为进一步探讨MMC治疗胃癌的分子机制奠定一定的理论基础。方法体外培养中分化人胃癌细胞株SGC-7901、低分化人胃癌细胞株MKN-45及正常胃粘膜上皮细胞GES-1,使用MTT法检测SGC-7901增殖情况,根据MTT的结果计算出MMC的IC50浓度来干预SGC-7901;提取各样本总RNA,并验证RNA质量,利用miRNA芯片技术,分别检测分析SGC-7901,MKN-45差异表达的miRNA,及用药物干预后SGC-7901差异表达的miRNA;采用实时定量RT-PCR对部分miRNA进行验证;运用DIANAmT,miRanda,miRDB,miRWalk,PICTAR4,PITA,RNA22,RNAhybrid及Targetscan软件预测miRNA-498可能调控的靶基因。结果1.与正常胃粘膜细胞GES-1相比,胃癌细胞株SGC-7901及MKN-45中有119个miRNA存在两倍及以上差异表达,其中SGC-7901有30个miRNA表达上调,25个miRNA表达下调;MKN-45有58个miRNA表达上调,33个miRNA表达下调;MKN-45与SGC-7901的miRNA表达谱有明显差异。2.MMC与SGC-7901细胞生长抑制率之间有浓度依赖关系,MMC48h的IC50为1.33μmol/L;MMC的IC50干预48h后的SGC-7901细胞与干预前SGC-7901细胞比较,存在60个差异表达的miRNA,其中miR-498、miR-1247等11个miRNA的表达明显上调,而在胃癌中的表达明显下调,另外miR-205*,miR-39242个明显下调的miRNA,在胃癌中的表达却是明显上调的。3.选取miR-33b,miR-498,miR-7,miR-185,miR-3924进行实时定量RT-PCR验证,其结果与芯片结果一致,证明miRNA芯片结果可靠。4.DIANAmT,miRanda,miRDB,miRWalk,PICTAR4,PITA,RNA22,RNAhybrid和Targetscan软件分析显示癌基因MDTH为miR-498的靶基因之一。结论1.胃癌细胞中存在差异表达的miRNA,且分化程度不同的胃癌细胞中亦存在差异表达的miRNA;2.MMC可以改变SGC-7901细胞中部分miRNA的表达水平;3.MMC对包括miR-498在内的这些miRNA的表达调控可能是其抑制胃癌细胞生长的途径之一
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