肺泡灌洗液靶向二代测序检测在儿童社区获得性肺炎诊疗中的应用价值

来源 :南昌大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liyumei1221
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目的:探讨肺泡灌洗液靶向二代测序(Targeted next generation sequencing tNGS)检测在儿童社区获得性肺炎诊疗中的应用价值。方法:选取2021年10月至2022年12月九江市妇幼保健院儿童呼吸内科收治的儿童社区获得性肺炎并行纤维支气管镜肺泡灌洗且外送靶向二代测序(tNGS)检测的192名患儿为研究对象,入院后予以经验性抗感染及对症治疗,完善血常规、红细胞沉降率(Erythrocyte sedimentation rate ESR)、降钙素原(Procalcitonin PCT)、D二聚体、呼吸道病原学、肺部影像学等检测,征得家属同意后完善纤维支气管镜肺泡灌洗,留取肺泡灌洗液两份,一份行常规细菌培养,另一份外送行tNGS检测。收集相关临床资料,包括性别、年龄、住院天数、临床诊断、炎性指标(白细胞、中性粒细胞、C-反应蛋白(C-reactive protein CRP)、PCT、ESR)、传统病原学检测结果、tNGS结果、影像学检查结果、治疗经过及转归等。对比两种检测技术的病原检出率、病原分布情况及两种方法检测符合率的一致性,并观察tNGS检测出的肺炎支原体序列数与疾病的临床表现及炎性指标的关联性。结果:1、符合本次研究纳入标准的共计192名患儿,男性患儿108名(56.25%),女性患儿84名(43.75%);年龄1岁1月~16岁,平均7岁;重症肺炎63例,为重症组(32.81%),非重症肺炎129例,为轻症组(67.19%);单一感染95例(49.48%),混合感染97例(50.52%)。重症组与轻症组、单一感染与混合感染性别差异均无统计学意义(χ~2=1.998,P=0.157;χ~2=1.000,P=0.317)。2、tNGS检测技术:192例患儿均检出病原微生物,检出率100%;检出细菌116例(60.42%)、病毒102例(53.13%)、肺炎支原体183例(95.31%)、真菌11例(5.73%);细菌感染中检出排名前三位的分别是肺炎链球菌63例(32.81%)、流感嗜血杆菌22例(11.46%)、金黄色葡萄球菌10例(5.21%);病毒感染排名前三位的分别是腺病毒B组28例(14.58%)、鼻病毒A型14例(7.29%)、人类疱疹病毒4型11例(5.73%);混合感染以肺炎支原体合并细菌感染最多,共35例(18.23%),第二为肺炎支原体合并细菌、病毒感染共24例(12.5%),第三为肺炎支原体合并病毒感染22例(11.46%)。3、传统病原学检测技术:157例患儿检出病原微生物,检出率81.77%;检出细菌1例(0.52%)、病毒4例(2.08%)、肺炎支原体156例(81.25%)、肺炎衣原体11例(5.73%);混合感染以肺炎支原体合并肺炎衣原体感染最多,共10例(5.21%)、第二为肺炎支原体合并病毒感染共2例(1.04%)。4、tNGS检测技术对细菌、病毒、肺炎支原体及真菌的检出率均明显高于传统病原微生物检测技术,差异有统计学意义(P<0.001);本研究中tNGS技术未检测出肺炎衣原体,而传统血清学检测显示肺炎衣原体抗体阳性,两者差异有统计学意义(χ~2=11.324,P=0.001)。5、轻症组中tNGS技术检出病例129例,单一感染63例(48.84%),混合感染66例(34.38%);重症组中检出63例,单一感染32例(16.67%),混合感染31例(16.65%);传统病原学检测技术在轻症组检出病例102例,单一感染99例(51.56%),混合感染3例(1.56%);重症组检出58例,单一感染49例(25.52%),混合感染9例(4.69%);tNGS检测技术在轻症组与重症组的混合感染检出率均显著高于传统病原学检测技术,差异有统计学意义(P<0.001)。6、结合患儿临床表现,对比两种检测方法的结果,tNGS检测技术和传统病原学检测的符合率一致性较弱(Kappa值=0.000,P=0.997)。7、分析tNGS技术检出的肺炎支原体序列数与住院天数、发热天数、激素使用时间、白细胞、中性粒细胞、CRP、D二聚体,ESR、PCT的关系,判断有无关联性,经Spearman相关分析示肺炎支原体序列数仅与白细胞呈负相关性,差异有统计学意义(rs=-0.155,P<0.05),与上述其他指标无相关性(P>0.05)。结论:1、tNGS技术能够提高细菌、病毒、肺炎支原体及真菌等病原体的检出率。2、tNGS技术比传统病原学检测技术病原检出率高,尤其对混合感染。3、肺炎支原体的序列数与疾病的临床表现及炎性指标无明显相关性。4、tNGS技术给儿童社区获得性肺炎提供了病原学依据,指导了临床诊疗。
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