利用全基因组表达谱芯片分析鸡热应激相关基因

来源 :华南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ben74
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
高温引起机体一系列的全身性非特异性反应称为热应激。热应激是一个复杂的生理过程,目前对鸡热应激的生理和病理变化已有了一定的研究报道。但对于影响和调控这一生理过程的分子机制缺乏系统的研究。本实验利用全基因组表达谱芯片检测鸡热处理前后的差异表达基因,并利用生物信息学方法分析其功能及相互之间的网络关系。旨在了解鸡热应激的分子机制,为筛选耐热性相关候选基因提供依据。   将24只(公母各半)8日龄雏鸡平均分为两组,每组12只。人工气候条件下,热应激组为40±1℃处理3小时,对照组为28±1℃。分别采集两组鸡大脑、肝脏和腿肌组织。利用全基因组表达谱芯片检测3种组织中的差异表达基因,选取其中10个基因,采用QRT-PCR方法进行验证并对相关的差异表达基因进行生物信息学分析。结果表明:   在大脑组织中有162个显著变化的差异表达基因(│change times│≥2,Q ≤5%),其中129个基因有完全基因注释,有39个生物学过程发生改变,其中与热应激有关的蛋白质折叠、热应激应答、细胞氧化还原稳态、蛋白质聚合、抗凋亡等过程表现为显著上调,而免疫应答与抗原递呈、细胞分裂发育则为显著下调;18个通路发生显著改变,其中显著上调的有钙信号通路和MAPK信号通路,下调的是脂类代谢和转化生长因子信号传导途径。   在肝脏组织中有339个基因在热应激前后发生显著改变,37个生物学过程发生了显著改变,其中与热应激有关并显著上调的主要有氧化还原反应过程、蛋白质折叠、抗凋亡过程,细胞周期、细胞增殖表现为显著下调;显著上调的信号通路包括钙离子信号通路和多种代谢通路,类固醇化合物的合成和细胞周期活动则显著下调。   在热应激前后,腿肌组织中有209个具有完全基因名称和注释的基因发生了显著改变,参与的生物学过程有31个,其中与热应激有关的蛋白质折叠以及代谢调节、细胞凋亡负调节、氧化还原反应、DNA修复正调节等生物学过程显著上调,细胞凋亡、细胞生长信号途径则显著下调;在腿肌中显著改变的Pathway中P53信号通路、MAPK信号通路和多种代谢途径上调,而下调的有细胞周期和转化生长因子信号途径。   实验结果揭示了鸡在热应激情况下,基因组整体表达发生变化,不同组织具有特异性的表达模式,3种组织中多个热应激蛋白家族基因被诱导上调表达;蛋白质折叠、抗凋亡过程、氧化还原反应等生物学过程增强;MAPK信号通路增强,而细胞周期和转化生长因子信号通路被抑制。
其他文献
LG-22/7型螺杆空压机是我国潜孔钻机上的配套设备。由于它的油冷却器机械强度低,工作条件又差,漏油严重,我矿历年的油耗高达0.217公斤/米以上。为了解决漏油问题,我们设计制
新厂设计或老厂原煤基地发生根本变化时,一个重要任务是确定原煤各粒级的分选制度,以期在特定条件下获得最大的精煤出量。所谓特定条件即是精煤质量特别是灰分要符合用户的
由于罗非鱼生长速度快、肉质鲜美、价格低廉,因此一直深受广大养殖户和消费者的喜爱。但因为罗非鱼是一种极不耐寒的热带鱼,所以其养殖区域只能限制在南方地区;即使在南方地区,如
GATA家族是能与核酸共同序列(A/T) GATA(A/G)相结合的转录因子,包括6个成员,即GATA-1,-2,-3,-4,-5,-6。目前研究表明,GATA家族中只有GATA-4和GATA-6在卵巢中共表达,GATA-4与人、小鼠、
本文应用模糊数学原理对皖南烟区烤烟氮素的施用量进行综合评判。结果表明:各处理在亩施相同的磷钾肥的条件下,以亩施3~6kg纯氮的处理,烤烟内外观综合指标达较好水平。 In this pape
蚕蛹是一种高营养价值的动物性高蛋白质饲料,因较高的脂肪含量,极易氧化酸败,含有一种特殊的腥臭味,另外还含有4%~6%的不易被动物消化吸收的几丁质,使得其利用价值和使用量在畜
本文以选自中国新疆、哈萨克斯坦、波兰等地区的31份杂花苜蓿(Medicago varia Martin.)种质作为供试材料。在建立优化的SRAP(Sequence-related Amplified Polymorphism)标记技术体系基础上,对31份供试材料的遗传多样性及抗病性进行分析研究,旨在探究该部分杂花苜蓿种质的遗传变异和亲缘关系,找出材料抗病性与遗传背景之间的联系,为抗病品种的标记辅助
本论文以实验室获得的假俭草体细胞无性系变异体为材料,通过实验室分析和田间观察相结合的方法,对其形态和抗逆性特征进行筛选和鉴定。得出的主要结论如下: 1.假俭草抗寒突变
通过调查牧草生育期、产草量、株高、越冬率、营养成分等生育指标,对国内124个牧草品种进行了引种试种试验。结果表明,豆科牧草中以莲江口三叶草和肇东紫花苜蓿在佳木斯地区生长最
在过去十年期间,矿物处理的操作单元的数学模拟经历了迅速发展的时期,现在有可能用经验或半理论模型来精确地予言大多数操作单元的定量模型。目前,在分级、磨矿和浮选的范围