三峡水库是三峡大坝蓄水形成的水体,总面积1084平方公里,淹没陆地面积632平方公里,范围涉及湖北省和重庆市的21个县市；175米正常蓄水位高程的总库容393亿立方米,总面积达1000多平方公里。鉴于三峡水库对于长江生态环境的重要意义以及目前该水体浮游植物研究的匮乏,本论文针对该水体的浮游植物群落展开了研究,获得如下主要研究结果:　　 2005年春季三峡水库蓄水至139m后,支流非回水区以及长江干流表现为河流型生态特征,硅藻种类数处明显优势,分别达到54.84％、55.56％,支流回水区表现为河流型和湖泊水库型的双重生态特征,硅藻和绿藻比例相当,均为39.13％。长江干流各采样点的浮游植物主要种类为中心纲的汉斯冠盘藻(Stephanodiscus hantzschii Grunow),浮游植物总细胞密度均低于1.00×106Cell·L-1。三峡水库支流部分水域暴发了藻类水华。支流48个样点中有30个样点的浮游植物总细胞密度超过了1.00×107 Cell·L-1,其中有部分区域虽然细胞密度没有超过1.00×107 Cell·L-1,但由于优势种类细胞体积较大,叶绿素α的浓度超过50μg·L-1,水体颜色发生了明显改变,为暗红色或酱油色。除大宁河的水华种类为绿藻门的实球藻(Pandorina morum)外,其他样点的水华种类均为甲藻门的倪氏拟多甲藻(Peridiniopsis niei Liu Pei et Hu)。以TWINSPAN数量分类为基础的DCA二维排序图将采样点分为4个生态类型,排序结果对回水区与非回水区的样点具有较好的指示作用。　　 三峡水库蓄水至156 m后枯水期与丰水期的浮游植物种类组成、细胞密度均具有显著差异(P<0.05),枯水期硅藻种类数占优势,丰水期绿藻种类数占优势,丰水期浮游植物细胞密度明显高于枯水期,年度间差异不显著。从西到东出现两条比较特殊的河流:乌江和大宁河。按照三峡水库回水顺序,大宁河位于东面,受回水影响较早,乌江位于最西面,受回水影响较晚。乌江2008年枯水期与前期相比颗粒沟链藻优势度大幅度提升,达到0.68,并出现美丽星杆藻。其中颗粒沟链藻优势度远高于优势种的评价标准,即优势度大于0.02。根据况琪军等前期报道,蓄水后一年期间,三峡坝前第一条大型支流香溪河曾出现以颗粒沟链藻、美丽星杆藻为优势种的现象。一般认为,硅藻(如沟链藻属)即使在外界存在物理干扰的情况下,依旧能保持较高的生长速率,因而通常认为是R-对策种。群落演替过程中先锋物种为R-对策种。据此证明颗粒沟链藻、美丽星杆藻为R-对策种,为三峡水库水体变化后的先锋物种。大宁河2008年枯水期首次出现水华束丝藻、微囊藻等优势种,微囊藻等属于S-对策种,通常生长缓慢,具有一定的调控机制以应对外界环境变化,细胞个体较大或呈群体。由此证明随着蓄水时间的推移,浮游植物群落逐渐由R-对策种占优势向S-对策种占优势演变。　　 从吴家湾和平邑口的甲藻细胞密度来看,水华暴发期和水华末期,甲藻均趋向于集中在0.5-5m水层。从时间尺度上来看,两者均在18:00达到最高值,经统计分析表明,两者甲藻细胞密度相关性显著。倪氏拟多甲藻具有一定的聚集规律,即白天趋向于聚集在水表层,显示出正向趋光性,晚上趋向于均匀分布或随机分布。值得注意的是,午时在水表层拟多甲藻细胞密度均出现明显的下降,可能是因为甲藻趋弱光,避强光,午时光照强度达到峰值,甲藻出现反向趋光性。据此初步推断倪氏拟多甲藻存在昼夜垂直迁移现象。吴家湾和平邑口各个因子的逐步回归分析结果具有共同的特征,即叶绿素α、水深、水下光照强度与水华期间甲藻细胞密度具有显著关系。水华期间,其他环境条件,包括营养盐、水温等适宜的情况下,水深、水下光照强度是影响甲藻昼夜垂直分布的重要因子。　　 2008年夏季三峡水库支流香溪河暴发微囊藻水华,同期在其上游古洞口二级水库发现肉眼可见的悬浮颗粒,经镜检鉴定,属于微囊藻属的铜绿微囊藻(Microcystis aeruginosa),与下游香溪河库湾水华优势种属同一种。三峡大坝蓄水至156m水位时,长江干流回水至兴山县高阳镇,处于古洞口二级水库下游,因而香溪河库湾的微囊藻不可能随水流回水至上游高海拔地区。从香溪河库湾微囊藻细胞密度的动态变化结果来看,XX06微囊藻细胞密度高于其下游的XX04、WJW,最先达到峰值3.82×108 Cell·L-1;之后XX06微囊藻细胞密度下降至2.1×108Cell·L-1,而XX04、WJW的微囊藻细胞密度升高,分别达到2.7×108 Cell·L-1,5.6×108Cell·L-1,之后又呈下降趋势。通过浮游植物种类组成的比较,香溪河库湾与古洞口水库的浮游植物种类组成相似度为80.95％。从水动力学角度考虑,古洞口二级水库至XX06的路程约为20 km,以平均水流速0.05 m·s-1的速度估算,古洞口二级水库至XX06大约只需4.6 d。由此证明古洞口水库浮游植物可能成为香溪河库湾的种子库之一。