【摘 要】
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猪传染性胃肠炎(Transmissible gastroenteritis of swine,TGE)是冠状病毒科冠状病毒属的猪传染性胃肠炎病毒(Transmissible gastroenteritis virus,TGEV)引起的一种猪急性肠道传染病,不同年龄和品种的猪均可感染,以呕吐、水样腹泻、脱水为特征,猪只感染常表现为隐性感染或是与其它病毒性腹泻病呈混合感染,暂时无有效的治疗药物,严重制
【基金项目】
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陕西省农业科技创新转化项目; 国家重点研发计划项目(编号:2016YFD05000706);
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猪传染性胃肠炎(Transmissible gastroenteritis of swine,TGE)是冠状病毒科冠状病毒属的猪传染性胃肠炎病毒(Transmissible gastroenteritis virus,TGEV)引起的一种猪急性肠道传染病,不同年龄和品种的猪均可感染,以呕吐、水样腹泻、脱水为特征,猪只感染常表现为隐性感染或是与其它病毒性腹泻病呈混合感染,暂时无有效的治疗药物,严重制约着我国养猪业的健康可持续发展,尽早发现和确诊病原对有效防控TGE有重大意义。常用的传统病原学诊断技术往往因操作时间过长不能满足快速确诊的要求,分子生物学和血清学诊断等技术又因检测成本和技术要求较高等原因,不适合在基层单位广泛使用,所以探究并建立一种简便灵敏的TGEV检测方法十分必要。本研究通过对比TGEV主要流行毒株的M基因序列,选择其高度保守的区域设计特异性内外引物,以羟基萘酚蓝(Hydroxy naphthol blue,HNB)为指示剂,建立了一种快速检测TGEV的可视化环介导等温扩增(Loop-Mediated Isothermal Amplification,LAMP)方法。建立的方法在63℃水浴锅中恒温扩增45 min后,85℃灭活Bst DNA Polymerase 10 min即可完成检测。研究中优化筛选反应内各组分浓度可得到最佳体系为:F3/B3与FIP/BIP引物浓度比1:6,其中d NTPs、Mg2+、甜菜碱终浓度分别为0.4mmol/L、4 mmol/L、0.4 mol/L,10×Bst DNA Polymerase Buffer 2.5μL、Bst DNA Polymerase 1μL、模板适量,羟基萘酚蓝(5 mmol/L)1μL,dd H2O补足至25μL。利用所设计的LAMP引物,分别对实验室保存的猪流行性腹泻病毒、猪轮状病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪细小病毒、猪圆环病毒和猪传染性胃肠炎病毒进行扩增,结果显示仅能检出TGEV,说明建立的TGEV LAMP检测方法特异性良好。以10倍倍比稀释的p ET-21b-M质粒为模板评价所建立方法的敏感性,结果显示最低检测限为3.7×10~3拷贝数,比普通PCR方法高两个数量级;在反应前向反应体系中加入HNB,反应结束后阳性反应管颜色从紫罗兰色变为天蓝色,阴性反应管颜色无变化,且阴阳性管颜色差异明显。采用建立的可视化LAMP方法对从陕西、宁夏及山东等猪场所收集的42份临床腹泻样品进行检测,可视化LAMP方法共检测到21份样品阳性,与琼脂糖凝胶电泳结果完全一致,而采用普通PCR方法仅检出4份样品阳性。本研究建立的TGEV可视化LAMP检测方法,在恒温水浴锅中约1 h即可完成,反应前在体系中加入HNB指示剂,既避免了开盖检测造成的气溶胶污染,又能达到对病原可视化检测的目的。该方法的建立提供了一种实用技术,使得基层临床相关单位能够更方便快速诊断TGE。
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