【摘 要】
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本文为了揭示这一高效治疗的复杂机制,我们应用系统生物学的理念和方法,通过整合基因芯片、二维凝胶电泳及质谱分析等手段,对APL细胞株NB4分别用RA、ATO及RA/ATO进行处理,并收集
【出 处】
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上海第二医科大学 上海交通大学医学院 上海交通大学
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本文为了揭示这一高效治疗的复杂机制,我们应用系统生物学的理念和方法,通过整合基因芯片、二维凝胶电泳及质谱分析等手段,对APL细胞株NB4分别用RA、ATO及RA/ATO进行处理,并收集不同时间段的样本,对基因和蛋白的表达大规模地进行动态性的定量分析。
本文在此基础上,我们发现了一系列与粒系分化及凋亡相关的分子调控网络的新特点,包括转录因子及辅助转录因子、钙信号通路、干扰素通路、泛素-蛋白酶体系统的激活,PML-RARα蛋白的降解和核体(NuclearBody)的重建,细胞周期阻滞及凋亡潜能的重新获得等。
本文对于受RA调变的基因,我们还对其上游的转录调控序列进行转录因子结合序列的频率扫描、权重矩阵和概率模型分析等数理统计的处理,发现包括RARE(维甲酸反应元件)在内的一些特定转录因子的结合序列在这些RA调变的基因中存在着富集分布的现象,从而在基因组水平对转录组及蛋白质组的信息进行了有力的补充。
本文还观察到:不同药理浓度的RA对粒系分化相关的转录因子的激活及粒系特征性的表面抗原并没有明显的剂量效应,但其对细胞周期阻滞及一些信号通路的下游分子的调控存在着RA剂量依赖效应。本研究不仅从时间、空间的角度对RA/ATO联合治疗APL的复杂机制取得了较为深入的了解,而且为其它白血病及实体瘤的研究开创了一个全新的研究模式。
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