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对9株乳源球菌株(5株乳酸乳球菌、3株嗜热链球菌和1株无乳链球菌)进行菌株水平上的多相分类鉴定。通过MRS固体平板培养基反复划线和形态学观察进行菌株的分离纯化,包括菌落观察、菌体细胞壁革兰氏染色的光镜观察和菌体常规磷钨酸负染色标本的透射电镜观察,并采用依据乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)和嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus)菌种水平上的生化代谢差异设计的生化试验和基于差异代谢的关键酶编码基因序列的差异设计引物的特异性PCR以及RAPD对这9株乳酸菌进行鉴定。依据菌落和菌体细胞的大小差异,划线分离得到11株乳酸菌;通过透射电镜观察,描述各菌体的大小、形状以及裂殖方式;生化试验得到了2个发酵型,将其鉴定为2个菌群(乳酸乳球菌乳酸亚种和嗜热链球菌),而特异性PCR扩增在菌株水平上将其鉴定为9株菌(6株乳酸乳球菌、2株嗜热链球菌和1株无乳链球菌),与RAPD鉴定结果(20个随机引物的RAPD筛选也得到了9个不同的基因型)一致。此外,本实验还获得了2个乳酸乳球菌的种特异性PCR引物LclamyLF-R和LclmapA2F-R、2个嗜热链球菌的种特异性PCR引物SttglgPF-R和SttamyLF-R以及乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp. lactis)株AS1.1936的株特异性PCR引物LclamyYF-R,并推测其α-淀粉酶基因(amyY)与其他乳酸乳球菌株之间存在序列差异。本实验进行Lactococcus lactis和Streptococcus thermophilus菌种菌株的表型特性及其分子水平的研究,首次比对其基于菌种水平分类的代谢酶编码基因的序列,设计菌种水平的特异性PCR引物,做出这些菌种不同菌株的PCR鉴定,并以1株经证实已应用于牛乳发酵的Streptococcus agalactiae作为对照,以达到更加可靠的分类和鉴别。为Lactococcus lactis和Streptococcus thermophilus的相关科学研究和工业化生产提供理论和技术基础,并为其他乳酸菌的分类鉴定提供参考。