为研究不同pH对酿酒酵母基因表达的影响,选用了 Pach培养基和麦芽汁培养基,在5L的发酵罐中分别在pH3.0、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、8.0、9.0条件下进行有氧培养,通过测序分析了不同pH条件下酿酒酵母的转录组。结果表明:在Pach培养基中,pH3.0与其它pH间差异表达的基因有 1416、1363、2026、3324、1925、3025、3159、3626、3104个。在 GO 数据库分别注释到 1654、1817、1544、1993、2259、2162、1619、2392、2113 个功能。在 KEGG数据库定位到 485、532、712、1217、795、1171、955、899、1111个代谢途径;在麦芽汁培养基中,pH3.0与其它pH间差异表达的基因有 1658、1824、1547、2003、2268、2169、1621、2405、2118 个。在 GO 数据库分别注释到 1654、1817、1544、1993、2259、2162、1619、2392、211 3 个功能。在 KEGG 数据库中定位到 612、673、575、695、830、794、504、844、705个代谢功能。在三羧酸循环和乙醛酸循环中筛选出的相关酶的基因表达量大部分随pH的增大而降低,表明在高pH条件会抑制这部分基因的表达。通过低pH和高pH条件下的比较表明:Pach培养基中pH3:pH8、pH3:pH9和麦芽汁培养基中pH3:pH8、pH3:pH9分别得到差异基因数目为3104、3626、2392、2113个。这些差异基因在GO富集分析中全部定位到生物过程,在KEGG pathway富集分析中发现,在酸碱环境跨度大的条件下,主要影响到遗传信息传递加工过程和碳水化合物的代谢过程。