20世纪90年代产生的高等教育创新产物--独立学院,经过10多年的发展取得一系列成就,新办学体制下的独立学院发展有着属于自己的发展理念与道路。加强独立学院学生干部队伍的思想政治教育是坚持独立学院办学方向、培养高素质合格学生干部人才的思想保证、推进独立学院改革与发展的精神动力和提高独立学院学生思想政治素质的重要手段。独立学院在学生干部队伍思想政治教育方面也取得了一定的成绩。但是,独立学院学生干部队伍仍然存在思想政治教育地位没有得到体现、学生干部队伍素质偏低、思想政治教育队伍配置不合理和稳定性差的困境。其原因具体包括：独立学院学生干部队伍思想政治教育理念存在偏差、教育环境错综复杂、教育方法单一和缺乏针对性、管理运行体制不健全等。独立学院学生干部队伍思想政治教育内容主要包括：理想信念和形势政策教育、爱国主义和奉献精神教育、道德教育和廉洁奉公教育、政治责任和工作能力培育教育。根据独立学院学生干部队伍思想政治教育的内容,加强独立学院学生干部队伍思想政治教育的对策可以从转变独立学院学生干部思想政治教育的理念；优化独立学院学生干部思想政治教育的环境；创新教育方法和健全独立学院学生干部思想政治教育管理体制着手。