葱属（Allium L.）植物是重要的蔬菜、药用、观赏和饲用植物种质资源。新疆野生葱属植物约69种，对寒、旱和贫瘠以及病虫害具有一定的抗性，为葱、蒜、韭等蔬菜的抗逆育种提供了宝贵的基因材料。本研究以新疆大蒜及其野生近缘种植物为研究对象，在引种条件下开展大蒜野生近缘种的物候生物学特性研究，基于核型特征、Giemsa C-带特征和ISSR分子标记分析了新疆大蒜及其野生近缘种的遗传多样性特征。主要结果如下：（1）野生近缘种3月初，地下芽萌动出土，进入营养生长期；随着温度的上升，完成生殖生长，在夏季高温来临之前，进入休眠，同年无二次生长，形成了避旱、避寒的年生活史特征。年生活周期为60~106d不等，奇台蒜和红旗达坂蒜年生活周期较短，而新疆蒜和圆头蒜年生活周期较长。（2）野生近缘种在花期第3~15d，开花振幅达到最高，开花振幅达到最高前后，成递增或递减的趋势。其主要形态特征为花被片6枚、雄蕊6枚和雌蕊1枚，子房腹缝线基部具帘的蜜穴或无。单花开花进程可分为花被片开裂、内轮花药散粉、内轮花药完全散粉、外轮花药散粉、花药完全散粉、花被片完全外翻、花丝完全萎蔫、花被片完全萎蔫、花柱完全萎蔫共计9个阶段；各近缘种间开花时间为5~15d不等。（3）采用常规压片进行核型研究，冰水混合物为最佳预处理方式。多籽蒜（FX）存在核型分化，有2n=2x和2n=3x两种类型，其余材料均为二倍体；多籽蒜（FY和FX）和圆头蒜（YU）的染色体基数为x=10，其余材料均为x=8；所有材料都有m染色体和sm染色体，多籽蒜（FY和FX）、圆头蒜（YU）和大蒜还有st染色体，中牟大蒜还有1条M染色体；多籽蒜（FY和FX）和圆头蒜（YU）为进化程度较高的2B型，其余均为进化程度较低的2A型；大蒜的m染色体和sm染色体上有数目不等的居间随体出现，大蒜随体与栽培季节以及生态环境存在一定的关系；健蒜、新疆蒜（RQ）和红旗达坂蒜（HK1）染色体的末端有随体出现，健蒜和新疆蒜的随体在短臂上，红旗达坂蒜的随体在长臂上。染色体结构及组成和进化程度存在种间差异，呈现多样性特点。（4）采用Giemsa C-带进行带型研究，HBSG法为最优体系。大蒜及野生近缘种显带数目、不完全显带数目和异染色质含量有所不同，异染色质含量主要集中在先端区和中间区。大蒜及其野生近缘种都有深染的末端带、中间带和着丝点带，数目和位置有所不同。野生近缘种中，除红旗达坂蒜（HK2）外，其余都有近端带；健蒜（JY）和新疆蒜（RQ）的短臂上存在随体带和次缢痕带，红旗达坂蒜（HK2）的长臂上有次缢痕带，但无随体带；多籽蒜（FY）和圆头蒜（YU）有数目不等的远端带。中牟大蒜和吉木萨尔白皮蒜含有所有带型，昭苏六瓣红无远端带，阿合奇大蒜无次缢痕带。新疆大蒜及其野生近缘种的遗传结构差异大，都存在或多或少的种质渗入。（5）采用ISSR分子标记手段进行遗传多样性特征分析，发现改良SDS法更适于DNA的提取。采用正交实验设计和单因素筛选结合法，筛选出ISSR-PCR反应最优体系为15μL：模板DNA75ng，dNTP浓度0.3mmol/L，Taq酶的浓度0.09U/μL，引物的浓度0.5μmol/L。从34个ISSR引物中共筛选出18个扩增稳定、条带清晰且多态性丰富的引物，共扩增出254个位点，多态性位点244个，多态性比率为96.06%。Nei’s基因多样度指数为0.1849~0.4697，平均值为0.3873；Nei’s遗传一致度为0.4606~0.9094；Nei’s遗传距离为0.0949~0.7752；香农信息指数为0.2815~0.6617，平均值为0.5642；多态性信息含量（PIC）为0.1511~0.3583，平均值为0.3047。基于DICE系数法，遗传相似系数为0.45~0.91，通过UPGMA法聚类，将新疆大蒜及其野生近缘种聚为4个类群11组。