Sipa1基因启动子序列及其SNPs结构和功能研究

来源 :华中科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:snailswuya
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SIPA1蛋白(signaling-induced proliferating-associating protein1)即信号诱导增殖相关蛋白1,是一个Rap1GAP(Rap1 GTPase activating protein)蛋白,它可以催化Rap1蛋白从活化的Rap1GTP形式转变为失活Rap1GDP形式,进而实现对Rap1蛋白功能的调节:细胞的粘附,细胞内激酶的活性,细胞核内基因的调控等。Sipa1基因位于第11号染色体上,由16个外显子组成,其翻译的蛋白由1042个氨基酸构成。  浸润性乳腺癌是女性中最常被诊断的癌症,早期诊断和精准治疗是提高生存率的关键。研究发现 SIPA1蛋白与乳腺癌的发生、增殖、粘附、浸润、转移等密切相关,可以促进乳腺癌的发生、浸润、转移,同时也有报道发现 SIPA1蛋白与结直肠癌、膀胱癌、前列腺癌、宫颈癌和黑色素瘤等癌症的转移浸润相关,可以调控前列腺癌的浸润和转移,还可以调节结直肠癌细胞的增殖和移动等。除了 SIPA1蛋白与癌症特征相关外,研究者们还发现Sipa1基因上面的两个SNPs位点,即rs931127和rs3741378,与宫颈癌的转移、非小细胞肺癌和乳腺癌的存活和发病也是密切相关的。SIPA1蛋白功能的多样化是如何实现的呢?其调控机制的研究是比较少的,因此,本论文主要从Sipa1基因的结构和功能进行了探讨,结果如下:  1)预测并构建了启动子区域的不同序列、采用双荧光素酶基因报告实验,定位了Sipa1基因的启动子位置,并且确定了Sipa1基因启动子的核心区域。  2)通过点突变构建了Sipa1基因启动子区的SNP rs931127(G>A)突变子,并采用双荧光素酶基因报告实验,发现该SNP没有显著影响Sipa1基因启动子的活性。  3)通过点突变构建了Sipa1基因第三个外显子上的SNP rs3741378(C>T)突变子(pcDNA3-flag-SIPA1 C和pcDNA3-flag-SIPA1 T),采用蛋白质免疫印迹实验证实该SNP,rs3741378(C>T),可以引起SIPA1蛋白的表达下降,并且差异显著。  4)通过测序,检测了不同肿瘤细胞系中Sipa1 gene SNP rs931127和rs374137,并研究了SIPA1蛋白在这些细胞中的SIPA1蛋白的细胞核亚定位,发现Sipa1基因的SNPs与SIPA1蛋白的细胞核亚定位没有显著的相关性。  总结以上实验结果主要是成功定位了Sipa1基因的启动子位置及其核心区域,不仅成功的揭示了Sipa1基因的结构,而且也为以后进一步研究SIPA1蛋白的被调控机制和鉴定与Sipa1基因相互作用的转录因子奠定了基础;同时,Sipa1基因上面的两个SNPs功能鉴定为以后的临床诊断也提供了依据。
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