小鼠TAp63γ的原核表达、纯化、结构及功能初步研究

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p53是人类肿瘤中发生变异频率最高的基因,在超过50%的自发肿瘤中都存在p53的突变或缺失,p53在多种肿瘤的生物学行为中均起着重要的调控作用。p63是近年来发现的继p73后的p53基因家族又一新成员,在DNA序列上与p53高度同源。由于转录时启动子的不同及C末端的选择性拼接,p63有6种亚型蛋白,分别为具有N端转录激活结构域的TAp63(包括TAp63α,TAp63β及TAp63γ)和缺失N端转录激活结构域的ΔNp63(包括ΔNp63α,ΔNp63β及ΔNp63γ)。p63的各种亚型对p53功能及细胞周期调控的影响存在差异,TAp63表达水平的提高可以促进细胞凋亡,起到抑癌基因功能;ΔNp63的过表达则抑制细胞凋亡,起到原癌基因作用。近期研究表明p63的功能还表现在发育调控上,p63是外胚层、面部和四肢发育的一个关键调控因子。在人类及小鼠中发现p63基因突变可造成至少5种发育紊乱性综合症:即先天性缺指(趾)畸形、外胚层发育不良、唇裂/腭裂综合症(EEC,ectrodactyly-ectodermal dysplasia and cleft lip/palate syndrome,OMIM604292);眼睑融合-外胚层缺陷-唇裂/腭裂综合症(AEC,ankyloblepharon-ectodermal defects cleft lip/palate syndrome,OMIM106260);肢体乳综合症(LMS,limb-mammary syndrome,OMIM603543);肢端-皮肤-爪-泪-齿综合症(ADULT,acro-dermato-ungual-lacrimal-tooth syndrome,OMIM103285)和拉普-霍奇综合症(RHS,Rapp-Hodgkin syndrome,OMIM129400)。此外,最近发现两种非典型综合症也因p63基因突变所致:即手/足裂畸形(SHFM4,split hand/foot malformation,OMIM 6052)和非综合症唇裂(NSCL,non-syndromic cleft lip)。鉴于p63在肿瘤发生及发育调控过程中的重要功能,其相关研究正成为近年来的热点。目前,人们对p63各亚型蛋白结构与功能的研究相对较少,此外尚无有关p63基因原核表达的报道。本论文对小鼠TAp63γ在原核系统中的表达、纯化、结构及功能开展了较系统的研究,并取得了相应的研究结果。首先,根据小鼠TAp63γ基因序列,设计特异引物,克隆到小鼠TAp63γcDNA,并构建得到了其原核表达重组质粒pGEX-2TK-TAp63γ。继而以构建的pGEX-2TK-TAp63γ重组表达质粒为母本,采用基因删除法得到小鼠TAp63γ两种缺失突变体的原核表达重组质粒(分别命名为pGEX-2TK-TAp63γDM1和pGEX-2TK-TAp63γDM2)。将所得到的重组表达质粒(pGEX-2TK-TAp63γ、DGEX-2TK-TAD63γDM1、DGEX-2TK-TAp63γDM2及pGEX-2TK)分别转化感受态E.coli BL21(DE3),IPTG诱导了GST-TAp63γ、GST-TAp63γDM1、GST-TAp63γDM2及Sj26GST的可溶性表达。随后探讨了融合蛋白(GST-TAp63γ)的最适表达条件(包括诱导时间、IPTG浓度、温度、培养基及一些外源小分子对表达的影响),在最适条件下诱导表达的菌液经离心收集菌体、超声破碎及Triton X-100增溶后获得可溶性表达蛋白粗提液,此蛋白粗提液经Glutathione Sepharose 4 Fast Flow亲合层析一步纯化后得到电泳均一的融合表达蛋白(GST-TAp63γ)。采用类似方法在最适条件下表达并纯化得到GST-TAp63γDM1、GST-TAD63γDM2及Sj26GST蛋白。将其中的融合蛋白GST-TAp63γ用蛋白酶(Thrombin)在最适条件下酶切并进行酶切后进一步纯化,得到去GST表达标签的TAp63γ蛋白。所制备的蛋白样品经纯度及浓度检测后,分装低温保存,备用。第二,以上述纯化得到的蛋白样品用于蛋白质结构与热稳定性研究。紫外吸收光谱测定表明TAp63γ在275 nm处有一特征紫外吸收峰;荧光发射光谱检测显示TAp63γ为典型的B类蛋白,荧光3-D扫描表明TAp63γ在340 nm处有一特征荧光发射峰;远紫外圆二色谱测定表明TAp63γ二级结构中富含α螺旋和β折叠,近紫外圆二色谱测定显示TAp63γ分子中富含二硫键。热稳定性研究表明TAp63γ对热不敏感,在75℃保温30 min后仍保持有大部分的可溶性;荧光淬灭研究表明,随着温度升高TAp63γ的特征荧光发射峰强度持续减小,在65℃及以下,荧光淬灭不明显,温度高于65℃时荧光淬灭显著加强;热诱导的远紫外圆二色谱测定表明,随着温度升高,TAp63γ分子中α螺旋含量减少,而无规卷曲含量增加;测定不同温度下TAp63γ与靶DNA结合活性表明,随着温度升高,其DNA结合活性减弱,但在50℃时仍表现出一定的DNA结合能力。化学交联法对TAp63γ聚合态分析表明,在体内其活性态可能是二聚体或四聚体,而Sj26GST主要为二聚体形式存在。同时借助蛋白色氨酸荧光发射光谱检测到Sj26GST的构象变化,结果显示脲处理后Sj26GST发生可逆变性,其构象变化为一步转变模式,变性曲线分析表明脲诱导的蛋白平衡态去折叠/重折叠过程中的变性自由能ΔG=34.46±0.16 kcal/mol,变性自由能对变性剂(脲)浓度的依赖性常数m=5.95±0.02 kcal/mol/M;进一步利用光谱手段测定了重金属汞离子(Hg2+)与Sj26GST的相互作用,紫外差谱测定表明Hg2+诱导了Sj26GST紫外区LMCT带的出现,随着Hg2+浓度的升高,LMCT带强度增大;荧光淬灭检测显示Hg2+对Sj26GST特征荧光发射峰有明显的淬灭作用,随着Hg2+浓度的增大,Sj26GST特征荧光发射峰强度持续减小,但最大发射峰的位置基本不变;圆二色谱测定表明,Hg2+微扰了Sj26GST的二级结构及高级结构,表现为α螺旋的含量略微减少,而无规卷曲含量有所增加,总体表现为Sj26GST高级结构变得更加疏松;抑制动力学测定表明,Hg2+对Sj26GST的抑制类型为非竞争性抑制,抑制常数(Ki)为1.64 mmol/L。第三,以纯化的GST-TAp63γ及Sj26GST蛋白分别免疫新西兰白兔,制备得到了两种蛋白的兔抗多克隆抗体。免疫双扩散、免疫印迹及免疫沉淀检测均证实制备得到了特异性高的兔抗GST-TAp63γ及兔抗Sj26GST多克隆抗体。此制备的兔抗GST-TAp63γ及兔抗Sj26GST多克隆抗体应用于TAp63γ与靶DNA和靶蛋白相互作用研究中均取得较好效果,这些抗体的获得为下一步对TAp63γ做深入研究作好了铺垫。最后,利用生物信息学方法及实验手段探讨了小鼠TAp63γ与靶DNA及靶蛋白间的相互作用。凝胶滞留分析(EMSA)表明仅野生型TAp63γ蛋白能特异结合p53靶序列(PG),且在50℃下仍保持有一定的结合活性,而其两种缺失突变体(TAp63γDM1和TAp63γDM2)都不能结合靶序列;为解释此现象,进一步借助生物信息学方法从分子水平上对TAp63γ的DNA结合结构域(DBD)进行了多重序列比对及同源建模,分析表明TAp63γDBD一级结构的完整性、关键氨基酸的保守性及三维结构的相似性可能是其保持DNA结合活性所必需的;对野生型TAp63γ的DNA结合活性作EMSA的Antibody supershift assay检测,结果表明生成了抗体—蛋白—探针三元复合物。同时利用GST沉淀技术研究了小鼠TAp63γ与小鼠p19ARF蛋白间的相互作用,结果显示能形成Glutathione Sepharose—GST-TAp63γ—p19ARF沉淀复合物,而不能形成Glutathione Sepharose—GST—p19ARF沉淀复合物,说明TAp63γ与p19ARF在体外能发生相互作用;同时借助免疫共沉淀技术分析小鼠TAp63γ与小鼠p19ARF蛋白间的相互作用,结果表明能形成抗体—GST-TAp63γ—p19ARF沉淀复合物,而不能形成抗体—GST—p19ARF沉淀复合物,显示TAp63γ能与p19ARF相互作用。两种检测结果均暗示TAp63γ与p19ARF可能处于同一细胞信号转导通路上,作为反式作用因子行使细胞周期调控因子的功能。
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